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紫花含笑TPS基因家族鉴定及萜烯类物质代谢关联研究
目录
内容概述................................................4
1.1研究背景与意义.........................................4
1.1.1紫花含笑的生态经济价值...............................8
1.1.2萜烯类物质的生物功能与应用...........................9
1.1.3TPS基因家族在植物次生代谢中的重要作用...............10
1.2国内外研究现状........................................11
1.2.1TPS基因家族研究进展.................................13
1.2.2萜烯类物质代谢研究进展..............................16
1.2.3TPS基因与萜烯类物质代谢关系研究进展.................17
1.3研究目标与内容........................................18
1.3.1研究目标............................................19
1.3.2研究内容............................................20
1.4技术路线与研究方法....................................21
1.4.1技术路线............................................22
1.4.2研究方法............................................24
紫花含笑基因组数据库构建及TPS基因家族鉴定..............25
2.1紫花含笑基因组信息获取................................26
2.1.1紫花含笑基因组序列下载..............................30
2.1.2基因组序列质量评估..................................31
2.2TPS基因家族成员挖掘...................................32
2.2.1TPS基因家族保守结构域分析...........................34
2.2.2紫花含笑TPS基因家族成员鉴定.........................35
2.3紫花含笑TPS基因家族系统发育分析.......................38
2.3.1紫花含笑TPS基因家族系统发育树构建...................39
2.3.2TPS基因家族分类及功能预测...........................40
2.4紫花含笑TPS基因家族基因结构分析.......................41
2.4.1TPS基因家族基因结构特征.............................44
2.4.2启动子区域顺式作用元件分析..........................45
紫花含笑TPS基因家族的表达模式分析......................46
3.1不同器官中TPS基因家族的表达分析.......................47
3.1.1花器官中TPS基因家族的表达...........................48
3.1.2叶片器官中TPS基因家族的表达.........................49
3.1.3根部器官中TPS基因家族的表达.........................53
3.2不同发育阶段中TPS基因家族的表达分析...................54
3.2.1花蕾期TPS基因家族的表达.............................56
3.2.2开花期TPS基因家族的表达.............................57
3.2.3花谢后TPS基因家族的表达.............................58
3.3逆境胁迫下TPS基因家族的表达分析.......................60
3.3.1旱胁迫下TPS基因家族的表达...........................62
3.3.2盐胁迫下TPS基因家族的表达
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