第3节单一顺序和重复顺序.pptVIP

第3节单一顺序和重复顺序第1页，共40页，星期日，2025年，2月5日单一序列（非重复序列）：基因在基因组中只有一个或几个拷贝，真核细胞中占40%-70%。真核细胞的大多数基因是单拷贝的，但是单一序列中只有百分之几的序列是编码基因的。而原核基因组中，大多数的单一序列是编码基因的。第2页，共40页，星期日，2025年，2月5日正向重复：正向重复(directrepeats)又叫顺向重复，这种重复序列的方向是相同的。比如l噬菌体的复制起点中的重复序列以及真核转座因子Ty，copia的两端，插入序列，转座子的两端的宿主序列以及端粒结构等

第3页，共40页，星期日，2025年，2月5日第4页，共40页，星期日，2025年，2月5日反向重复(Invertedrepeats)：同一个序列的两个拷贝在一个分子中以相反的方向重复，相邻重复组成回文序列。由反方向互补的两个DNA片段组成，两个反转重复序列又叫回文序列(palindromesequence)。呈两侧对称的序列，常存在于插入序列和转座子两端的结构元件中。第5页，共40页，星期日，2025年，2月5日第6页，共40页，星期日，2025年，2月5日第7页，共40页，星期日，2025年，2月5日画上荷花和尚画书临汉字翰林书正反相同第8页，共40页，星期日，2025年，2月5日在高度重复序列中，有一种是反向重复序列，也叫回文结构；长度不等，从几个核苷酸到几百个核苷酸等。第9页，共40页，星期日，2025年，2月5日这种反向重复序列在基因组中很多，据推测可能与基因的复制、转录等调控有关。与DNA结合的蛋白质多以二聚体的形式结合，这时会发现结合位点的DNA多具有回文结构的特点。第10页，共40页，星期日，2025年，2月5日回文结构的意义：1）是限制性内切酶的识别位点。2）具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子。3）转录终止时的识别结构。4）有利于稳定RNA的结构和行使功能。5）基因工程中DNA序列的方便操作。第11页，共40页，星期日，2025年，2月5日三.?轻度重复顺序和中度重复顺序轻度重复顺序在基因组中含有2-10拷贝，酵母tRNA基因、人和小鼠的珠蛋白基因等。中度重复顺序长约300bp基因组中约有10-几千个拷贝的顺序如rRNA和tRNA基因tRNA基因一般都分布于基因组中，而rRNA常集中分布于核仁形成区。第12页，共40页，星期日，2025年，2月5日第13页，共40页，星期日，2025年，2月5日第14页，共40页，星期日，2025年，2月5日第15页，共40页，星期日，2025年，2月5日第16页，共40页，星期日，2025年，2月5日四Alu家族长约300bp；Alu顺序也称为短的分散因子（shortinterspersedelements,SINEs）。由RNA多聚酶III转录的。在基因组中30万个拷贝；在170bp处有一AluI的酶切位点；由两个130bp的串联重复顺序组成；在二聚体的右半部有31bp插入序列，此插入顺序来自7SLRNA。Alu顺序有何应用价值？第17页，共40页，星期日，2025年，2月5日在人基因组中Alu基因家族是一个中等重复序列，长度在300bp左右，单倍体基因组中有30万份，分散在各染色体上。在170bp处有一个限制性酶切位点Alu。基因组中平均每5kb出现一次Alu序列，因此在基因的内含子以及基因附近的序列中有许多。第18页，共40页，星期日，2025年，2月5日Alu家族的每一个成员都很相似，由130bp的串联重复组成，常见的是二聚体形式，在右半部分的中部有一个31bp的无关序列插在中间。这个插入序列（IS）来自7SL（是信号识别蛋白SRP的一个成分）。31bpIS第19页，共40页，星期日，2025年，2月5日Alu家族的广泛存在说明其可能具有某种功能，但是目前还不十分了解。第20页，共40页，星期日，2025年，2月5日在小鼠体中有一种和Alu序列同源的序列叫做B1家族，约有5万个成员。重复单位为130bp，相当于Alu序列的一个单体，和Alu序列的同源性为70%-80%。第21页，共40页，星期日，2025年，2月5日KpnⅠ家族是中度重复顺序中仅次于Alu家族的第二大家族。用限制性内切酶KpnⅠ消化人类及其它灵长类动物的DNA，在电泳谱上可以看到4个不同长度的片段，分别为1.2,1.5,1.8和1.9kb，这就是所谓的KpnⅠ家族。KpnⅠ家族成员顺序比A