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黄姑鱼低温耐受性QTL定位与分子机制解析
目录
一、文档概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1.1黄姑鱼养殖现状与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.1.2低温环境对黄姑鱼的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
1.1.3QTL定位与分子机制研究的价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.2国内外研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
1.2.1主要经济鱼类的低温耐受性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
1.2.2QTL定位技术在鱼类遗传改良中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
1.2.3鱼类抗寒分子机制研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
1.3本研究的目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
二、研究材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.1.1黄姑鱼遗传群体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.1.2研究群体基本信息．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.2低温胁迫处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
2.2.1胁迫条件设置．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.2.2胁迫下鱼类生理指标测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
2.3低温耐受性表型鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
2.3.1生长性能测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
2.3.2抗寒能力评估指标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
2.4QTL定位分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
2.4.1基因组测序与数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
2.4.2QTL作图方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
2.4.3QTL定位结果统计分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.5分子机制解析策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
2.5.1关键QTL区域的基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
2.5.2基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
2.5.3功能验证实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
三、黄姑鱼低温耐受性QTL定位结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
3.1低温胁迫下表型分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.1.1生长指标变化规律．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53
3.1.2抗寒能力表型差异．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.2QTL定位结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.2.1主效QTL的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56
3.2.2量性状QTL的分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
3.2.3QTL连锁图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
四、黄姑鱼低温耐受性关键基因鉴定与功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．59
4.1重点QTL区域基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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