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黄姑鱼低温耐受性QTL定位与分子机制解析

目录

一、文档概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1黄姑鱼养殖现状与挑战．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.1.2低温环境对黄姑鱼的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.1.3QTL定位与分子机制研究的价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.2国内外研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2.1主要经济鱼类的低温耐受性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2.2QTL定位技术在鱼类遗传改良中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.3鱼类抗寒分子机制研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.3本研究的目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

二、研究材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.1.1黄姑鱼遗传群体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

2.1.2研究群体基本信息．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.2低温胁迫处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.2.1胁迫条件设置．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.2.2胁迫下鱼类生理指标测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.3低温耐受性表型鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.3.1生长性能测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.3.2抗寒能力评估指标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.4QTL定位分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.4.1基因组测序与数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.4.2QTL作图方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.4.3QTL定位结果统计分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.5分子机制解析策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.5.1关键QTL区域的基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

2.5.2基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.5.3功能验证实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

三、黄姑鱼低温耐受性QTL定位结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

3.1低温胁迫下表型分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.1.1生长指标变化规律．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

3.1.2抗寒能力表型差异．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

3.2QTL定位结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

3.2.1主效QTL的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.2.2量性状QTL的分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

3.2.3QTL连锁图谱构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

四、黄姑鱼低温耐受性关键基因鉴定与功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．59

4.1重点QTL区域基因鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．