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ICS65.020.20CCSB05
45
广西壮族自治区地方标准
DB45/T2754—2023
芒果品种鉴定技术规程SSR分子标记法
CodeofpracticeidentificationofmangovarietiesbySSRmolecular
markermethod
2023-08-10发布2023-09-30实施
广西壮族自治区市场监督管理局发布
DB45/T2754—2023
I
目次
前言 II
1范围 1
2规范性引用文件 1
3术语和定义 1
4缩略语 1
5原理 2
6材料和试剂 2
6.1一般规定 2
6.2试剂 2
6.3溶液配制 2
7仪器和设备 3
8SSR引物序列信息 3
9操作步骤 4
9.1样品采集 4
9.2DNA提取 4
9.3PCR扩增 4
9.4PCR产物检测 4
10数据记录与统计 5
10.1数据记录 5
10.2统计 5
11结果判定 6
11.1判定方法 6
11.2结果表述 6
附录A(规范性)引物序列信息 7
DB45/T2754—2023
II
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件由广西检验检疫标准化技术委员会提出、归口并宣贯。
本文件起草单位:广西益谱检测技术有限公司、广西博测检测技术服务有限公司、广西智标云信息科技有限公司、广西绿保环境监测有限公司、南宁海关技术中心、广西壮族自治区种子管理站、百色市检验检测中心、南宁维尔凯生物科技有限公司。
本文件主要起草人:赵永锋、莫薇、何京明、杨桂强、罗贵文、梁俊、薛海燕、黄小娟、莫璋红、刘新彩、郑美玲、黄鹂、李丽、吴妮、官月香、韦东、梁群清、苏丽梅、仝丹丹、刘守廷。
DB45/T2754—2023
1
芒果品种鉴定技术规程SSR分子标记法
1范围
本文件界定了芒果品种鉴定技术的相关术语和定义,规定了利用简单重复序列(simplesequencerepeat,SSR)分子标记法进行芒果品种鉴定的原理、材料和试剂、仪器设备、引物序列信息、操作步骤、数据记录和统计、结果判定。
本文件适用于广西壮族自治区行政区域内基于SSR分子标记的芒果品种SSR指纹数据采集和品种鉴定。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
NY/T2594植物品种鉴定DNA分子标记法总则
3术语和定义
NY/T2594界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
核心引物coreprimer
品种鉴定中优先选用一套简单重复序列(SSR)引物,其检测位点具有多态性高、重复性好等综合特性。
3.2
对照品种controlvariety
具有所用SSR位点上不同等位变异的特性,用于辅助确定待测样品的等位变异,校正仪器设备的系统误差的一类品种。
3.3
聚合酶链式反应polymerasechainreaction
利用DNA在体外摄氏95℃高温时变性会变成单链,低温(经常是60℃左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72℃左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5-3)的方向合成互补链。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
SSR:简单重复序列(SimpleSequenceRepeat)。
PCR:聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction)。
DNA:脱氧核糖核酸(DeoxyriboNucleicAcid)。
DB45/T2754—2023
2
5原理
不同品种芒果的基因组成不同,其基因组中SSR的重复次数存在差异,根据SSR的差异,通过PCR扩增及电泳技术可以鉴定芒果品种。
6材料和试剂
6.1一般规定
除另有说明外,本文件中使用
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