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中药学答辩记录范文

答辩基本信息

答辩人：[姓名]

专业：中药学

论文题目：《基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪-丹参药对治疗冠心病的作用机制》

答辩过程

答辩人陈述

答辩人：尊敬的各位老师，大家好！我是[姓名]，我的论文题目是《基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪-丹参药对治疗冠心病的作用机制》。冠心病是一种严重危害人类健康的心血管疾病，其发病率和死亡率呈逐年上升趋势。黄芪和丹参是临床治疗冠心病常用的药对，二者配伍使用具有益气活血、化瘀通络等功效，但具体作用机制尚不明确。

本研究运用网络药理学和分子对接技术，旨在系统全面地揭示黄芪-丹参药对治疗冠心病的作用机制。首先，我通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出黄芪和丹参的活性成分及其作用靶点，利用GeneCards、OMIM等数据库获取冠心病的疾病靶点。然后，将药物靶点与疾病靶点进行映射，得到交集靶点。通过构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，筛选出核心靶点。接着，运用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后，采用AutoDockVina软件对核心靶点和活性成分进行分子对接验证。

研究结果显示，黄芪-丹参药对中筛选出了112个活性成分，对应235个作用靶点，冠心病相关靶点有1432个，二者交集靶点有78个。PPI网络分析得到10个核心靶点，包括AKT1、TNF、IL6等。GO功能富集分析表明，这些交集靶点主要参与了炎症反应、氧化应激、细胞凋亡等生物过程。KEGG通路富集分析发现，黄芪-丹参药对主要通过调控PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等发挥治疗冠心病的作用。分子对接结果显示，黄芪-丹参药对的活性成分与核心靶点具有较好的结合活性。

综上所述，本研究通过网络药理学和分子对接技术，初步揭示了黄芪-丹参药对治疗冠心病的多成分、多靶点、多通路作用机制，为进一步深入研究该中药药对提供了理论依据，也为临床合理用药提供了参考。谢谢大家！

专家提问与答辩人回答

提问1（教授A）：在筛选黄芪和丹参的活性成分时，你依据的TCMSP数据库中活性成分的筛选标准是怎样的？这些标准是否合理，是否存在局限性？

答辩人回答：在TCMSP数据库中，我筛选活性成分主要依据两个标准，即口服生物利用度（OB）≥30%和药物相似性（DL）≥0.18。口服生物利用度反映了药物进入人体循环系统的程度，设定OB≥30%是为了确保筛选出的成分能够在体内达到一定的浓度，从而发挥药效。药物相似性是衡量化合物与已知药物分子结构相似程度的指标，DL≥0.18有助于筛选出具有潜在药物活性的成分。

这些标准在一定程度上是合理的。它们是基于大量的药物研究和经验总结得出的，能够从众多的化学成分中筛选出相对更有可能成为药物的活性成分，减少后续研究的工作量。然而，这些标准也存在一定的局限性。一方面，它们是基于传统的药物研发理念，可能忽略了一些虽然口服生物利用度低或药物相似性不高，但在体内通过特殊机制发挥作用的成分。另一方面，这些标准没有考虑到中药复方中成分之间的协同作用，可能会遗漏一些需要与其他成分共同发挥药效的活性成分。

提问2（副教授B）：在构建PPI网络时，你是如何确定核心靶点的？这些核心靶点的确定对于揭示黄芪-丹参药对治疗冠心病的机制有什么重要意义？

答辩人回答：在构建PPI网络后，我使用Cytoscape软件中的CytoHubba插件，采用Degree算法来确定核心靶点。Degree算法是基于节点的连接度，即与该节点相连的边的数量。连接度越高，说明该节点在网络中与其他节点的相互作用越广泛，越有可能是核心节点。我选取连接度排名前10的节点作为核心靶点。

这些核心靶点的确定对于揭示黄芪-丹参药对治疗冠心病的机制具有重要意义。核心靶点是PPI网络中的关键节点，它们在生物网络中起着枢纽作用，参与了众多的生物过程和信号通路。通过研究这些核心靶点，我们可以了解黄芪-丹参药对作用的关键分子，进而推断其可能的作用机制。例如，本研究中得到的核心靶点AKT1、TNF、IL6等，分别参与了细胞存活、炎症反应等重要生物过程。黄芪-丹参药对可能通过调节这些核心靶点的活性，影响相关的信号通路，从而发挥治疗冠心病的作用。因此，核心靶点的确定为进一步深入研究黄芪-丹参药对的作用机制提供了重要的切入点。

提问3（讲师C）：在进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析时，得到的结果涉及多个生物过程和信号通路，你如何确定哪些是黄芪-丹参药对治疗冠心病的关键生物过程和信