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合成后的新生肽链在ER膜上或在ER腔中必须经过折叠，分拣并被运输。分泌蛋白和膜蛋白在它们运输到细胞表面的过程中要经历5种基本的修饰;1.二硫键的形成
2.新生肽链的正确折叠
3.糖基化修饰
4.肽链的水解
5.多亚基蛋白的组装;（一）二硫键的形成;;;二硫键在内质网腔中是顺次形成的：;;;（二）新生肽链的正确折叠;;（三）多亚基蛋白的组装;;三.内质网中蛋白的质量控制;3.内质网居留蛋白;;四.蛋白质的糖基化;1.N-连接寡糖和O-连接寡糖;;糖蛋白中的糖残基前体:二磷酸或单磷酸核苷酸单糖;所有核苷酸糖前体在细胞质基质中合成：;ER和高尔基体膜上有核苷酸糖的反向协同运输载体：;2.典型O-连接寡糖链的合成;3.N-连接寡糖链的形成及加工;14寡糖前体的生物合成：;;只有在三肽序列中的天冬氨酸上才能加上寡糖链：
Asn—X—Thr
或
Asn—X—Ser
其中X是除了proline（脯氨酸）以外的任何氨基酸。
寡糖链前体一加到新生肽链上，就马上在三种酶的作用下去除3个葡萄糖和一个甘露糖残基。;;;4.N-连接和O-连接寡糖的作用;五.膜泡运输;支;;非笼形蛋白衣被小泡;;（二）Rab蛋白家族指导运输膜泡到正确目的地;下面让我们浏览一下整个分泌途径膜泡运输的过程;六.高尔基体及以后的蛋白分拣和加工;（一）保留在高尔基体中的蛋白;（二）连续型分泌和调控型分泌;(三)肽链的水解;;;;七.细胞表面膜蛋白的分拣;;八.膜脂的生物合成;1.磷脂的合成;2.磷脂在双分子层上的平衡;3.磷脂从ER到其它生物膜的输送
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