微生物的进化系统发育和分类鉴定.pptxVIP

微生物的进化系统发育和分类鉴定;目的要求： 通过本章学习，要求学生掌握： 1、进化指征的选择 2、微生物分类学的基本知识 3、微生物的分类鉴定方法 重点： 微生物的分类依据及方法。 难点： 代表原核微生物的拉丁学名和主要特点。 ;第一节 微生物的进化和系统发育;一、进化的测量指征;16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺” 或“分子计时器” ：;3. rRNA的顺序和进化;4. 基于rRNA的系统发育树;Eubacteria （真细菌界）;进化树意义：将生物分为三界（细菌、古生菌、真核生物） 随着资料的进一步积累，系统树还会做进一步修改 生物间存在广泛的水平的或横向的基因交换 基因的垂直传递不是影响生物进化的唯一过程 ; 界 （Kingodm） 门 (phylum) (亚门) 纲 (Class) (亚纲) 目 (order) (亚目) 科 (family) (亚科) 族 (group) (亚族) 属 (genus) (亚属) 种 (species) 微生物分类的基本单位是“种”;种：分类特征高度相似、而又与同属内的其它种存在明显差异的菌 株群。 ;1、亚种（subspecies，subsp，ssp．） 是种的进一步细分的单元，是正式分类单元中最低的分类等级。一般是指菌种在某一个特征上与模式种有明显而稳定的差异，但又不足以区分为新种。;4、菌株（strain） 从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用实验方法（诱变等）所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。 ;8、克隆: 是从单个亲本细胞得来的细胞群体。 ;1 新种的命名不应与已发表的真菌，藻类、原生动物同名。 2. 种名要用拉丁文, 用双名法表示，新种要有典型菌株，新属要有 典型种，并要同时发表菌种的保藏号。 3. 新种(属)要在“??际系统分类细菌学杂志”(IJSB)上发表。 4. 菌名的更改要得到仲裁委员会同意，并发表在IJSB上才能有效。 ;双名法规定:一个生物的种名,由“属名+种名”构成，用斜体表示。;新名称的发表;第三节 微生物在自然界的地位;五界系统 ;三原界系统;;;细菌的分类和伯杰氏手册; 关于细菌的分类系统，世界比较权威的细菌分类系统有三个： ①、前苏联克拉西尼柯夫系统 ②、法国的普雷沃系统 ③、美国的伯杰氏系统 ;《伯杰氏鉴定细菌学手册》;《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology);1、《伯杰氏系统细菌学手册》第一版（1984－1989）的分类; 《伯杰氏细菌鉴定手册(第九版)》将原核微生物分为35群，归纳为四大类(或四个门)： 第一类，具细胞壁的革兰氏阴性真细菌； 第二类，具细胞壁的革兰氏阳性真细菌； 第三类，无细胞壁的真细菌； 第四类，古细菌。 ; 《伯杰氏系统细菌学手册》第二版将原核生物分为古细菌和真细菌2个界，下设25门，39纲，89目，207科，包括852属，5000余种，分为五卷本出版。;;;;;;Ainsworth　系统;安斯沃思(Ainsworth,1973)的分类系统： 真菌界的门和亚门分类检索表 1有原生质团或假原生质团………………粘菌门Mycomycota1无原生质团或假原生质团，同化阶段为典型的菌丝体 　　　　　　　　　　　　　　　………真菌