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生物信息实验 (总 16 页) --本页仅作为文档封面，使用时请直接删除即可-- --内页可以根据需求调整合适字体及大小-- 生物信息学实验讲义 2 目 录 实验 1. 计算机网上操作基本技能训练……………………………1 实验 2. 常用分子生物学数据库类型、文件格式及数据库查询…2 实验 3. 核酸序列分析………………………………………………3 实验 4. 多重序列比对及系统发生树的构建………………………5 实验 5. PCR 引物设计及评价………………………………………7 实验 6. 蛋白质序列分析和结构预测………………………………9 3 实验一 计算机网上操作基本技能训练 【实验目的】 1、熟练掌握上网操作基本方法及技能。 2、掌握利用网络进行资料搜集的多种方法 【实验内容】 1、熟悉 Internet Exporer 的基本使用方法及相关技巧，熟悉 Internet Exporer 网络配置。 2、掌握免费电子邮箱的申请方法并且能收发电子邮件。 3、掌握网上软件下载及安装方法。 4、用 IE或 netscape 等浏览工具浏览、有哪些信誉好的足球投注网站各类信息 5、运用FlashGet 或网络蚂蚁等下载工具进行网络资料的下载以及运用各 种上传工具上传资料到网络 6、利用Winzip 或 Winrar 等压缩工具进行文件的压缩与解压 7、学习使用ftp 8、在网上自主学习了解生物信息学知识 【作业】 1、在D 盘建立一个以自己名字命名的文件夹。 2、申请一个自已的免费电子邮箱，并发一封电子邮件到。 3、从网络上下载任意一个软件，并安装到计算机上。 4、用FTP 获取一个蛋白质结构分析软件比如 rasmol，下载后保存到你的文 件夹中，以便以后运用其进行蛋白质结构分析。 5、下载一个有关生物信息学的教程，并保存到你的文件夹中，进行参考学 习。 附表: 相关软件及有哪些信誉好的足球投注网站工具网址 有哪些信誉好的足球投注网站工具或软件名称 参考网站地址 Winrar / winzip / 网络蚂蚁 Netants / FlashGet / rasmol 有哪些信誉好的足球投注网站引擎 有哪些信誉好的足球投注网站引擎 新浪有哪些信誉好的足球投注网站引擎 搜狐有哪些信誉好的足球投注网站引擎 4 实验二 常用数据库类型、文件格式及数据库查询 【实验目的】 1、掌握序列检索的操作方法； 2、熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义； 3、了解EBML数据库序列格式及其主要字段的含义； 4、熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存； 5、熟悉分子生物学软件的有哪些信誉好的足球投注网站与下载。 【实验内容】 1、使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC060830和NM_000230，连接 提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其含义； 2、GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存； 3、使用SRS信息查询系统检索核酸序列BC060830，连接提取该序列内容， 阅读序列格式的解释，理解其含义； 4、使用有哪些信誉好的足球投注网站引擎有哪些信誉好的足球投注网站并下载DNAClub和BioEdit软件。 【作业】 1、写出核酸序列BC060830 在GenBank数据库的主要字段的含义； 2、写出核酸序列NM_000230 在EBML数据库的主要字段的含义 5 实验三 核酸序列分析 【实验目的】 1、掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；