植物分子生物学.pptxVIP

植物分子生物学一生物信息学基础（10学时）主要内容绪论.2学时 分子数 据库及NCBI序 列检索双序列比对及BLAST比对工*一 4学时争序列比对和分子系统，育 ] 4学时核酸和蛋白质序列分析工具主要参考书1.基础生物信息学及应用, 出版社蒋卓等，清华大学2.生物信息学方法与实践, 科学出版社张成岗、贺福初,3. 生物信息学，赵国屏等，科学出版社4. 生物信息学一基因和蛋白质分析的使用指南, 李衍达，清华大学 出版社5.生物信息学与功能基因组学，孙之荣主译,化学工业出版社6. Bioinformatics :sequence and genome analysis, David W. Mount, 科学出版社7. Instant Notes in Bioinformatics （影 印版），科学出版社1.1生物信息学产生背景Growth of GenBank(1982 ? 2005)GenBank Data54s:5€4jM44424c3t3(34323c2(2€242s2c1c1t141:1c￡€5S5654S25048464442403836343230282624222018161412108GSequencesaYeBase Pairs2891680,338606(silo三一q) ZQ -0 ￡2 ss3892,274,0292,4273o2036,553,368,48530,968,4180420044,575,745,17640,604,3190520056,037,734,46252,016,7621.2生物信息学定义生物信(Bioinformatics):是一门交叉科学， 它包含了生物信息的获 取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方它综合运用数学、科学等工具，来阐明和理解大量生物数据所包含的生物学意义O数学汁算机信息生物1.3生物信息学目标任务?收集和管理生物分子数据?数据分析和扌容掘? 开发分析工具和实用软件-生物分子序列比较工具—基因识另U工具-生物分子结构预测工具-基因表达数据分析工具1.4生物信息学研究内容尸 序列比对 (Sequence Alignment)＞蛋白质结构预测＞计弃机辅助基因识别＞非编码区分析和D N A语言研究＞分子进1七和t匕较基因组学＞序列重叠群装配＞遗传密码的起源＞ 基于结构的药物设计基因表达谱分析，代谢网络分析，基因芯片设计和蛋 白质组学数据分析等15国内夕卜生物信电网址?国夕卜?美国国家生物技术与信息中心（NCBI）I络组织（EMBnet）?欧洲分子生物学」专业节点:?欧洲生物信息研究所（英国，EBI）? Sanger研究所（英国，Sanger）□家节点：?瑞士（SIB）___大到亚_^ANGISJ______ 日 本国立遗传学研究所 （NIG）? NCBINational Center for Biotechnology InformationNational Library of Medicine National liistiiuies of HeultliBooks ____Tax BrowserStructure IPubMed All Databases BLASTOMIM回Search All Databases? What does NCBI do?Hot SpotsSITE MAP Alphabetical List Resource Guide? Assembly ArchiveEstablished in 1988 as a national resource for molecular biology information. NCBI creates public databases, conducts research in computational biology, develops software tools for analyzing genome data, and disseminates biomedical information ? all for the better understanding of molecular processes affecting human health andAbout NCBI An introduction to NCBI? Clusters of orthologous groups Coffee Break, Genes Disease, NCBI HandbookGenBankSequence submission support and softwaredisease. More...|网址；Literature databases PubMed.