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C值(C-value):单倍体基因组中的全部DNA量(bp) 人类基因组染色体 (一)染色体DNA的组成 核小体 1. 单一序列DNA(unique sequence DNA ) 单一序列在人类基因组中大于50%。结构基因主要存在于单一序列中。 单拷贝DNA(single copy DNA) 2. 高度重复序列DNA (highly repetitive DNA) 卫星DNA(satellite DNA) 反向重复序列 (inverted repeats) 重复次数106次 (1) 卫星DNA 存在于非编码区的串联重复序列, 在基因组中约占5%。 主带 光 密 度 卫星DNA a. 大卫星(macro-satellite)DNA: 重复单位5-10 bp,其在人群中多态性不显著。 光密度260nm 果蝇基因组 b. 小卫星(minisatellite) DNA: 重复单位9-24 bp,呈高度多态性。 可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeat,VNTR) 端粒DNA:(TTAGGG)n,2-20 kb, 染色体复制,末端保护。 核心序列 GGGCAGGAXG; c. 微卫星DNA (macro-satellite DNA) 短串联重复(short tandem repeat,STR) 重复单位2-6bp,常见为(AC)n和(TG)n, 重复次数10-60次,总长度小于150bp, 高度多态性,可作遗传标记。 (2). 反向重复序列 5`AAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTT3`3`TTTGGTGGCGACCATCGCCACCAAA5` 5`AAACCACCGCTAGCGGTGGTTT3`3`TTTGGTGGCGATCGCCACCAAA5` 回文结构 两个顺序列相同的拷贝在DNA链上呈反向排列。在基因组中约占5%,常见于基因调控区。 3.中度重复序列: tRNA、rRNA 组蛋白、免疫球蛋白 可能与基因调控相关序列 重复次数10-105,约占基因组的35% Alu家族: 有AluⅠ酶切位点(AG/CT)而得名。 重复单位约300bp, 由两个130bp重复序列及31bp间隔序 列组成;重复30-50万次,散在分布; 灵长类特有。 等位型1 等位型2 (二)基因组序列多态性 两个同源DNA序列中同一碱基位置含有不同的核苷酸。 1.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP) 2. 限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism) ↓ ↓ DNA1-1 ↓ DNA1-2 用一种限制性内切酶消化不同个体的同一段DNA时,由于碱基组成的变化而改变限制性内切酶识别位点,从而会产生长度不同的DNA片段。 (三) 多基因家族(multigene family) 1.基因超家族(supergene family) 由多基因家族及单基因组成,成员间有不同程度的同源,但它们的功能不一定相同。 是指一组有类似功能,核苷酸序列又有同源性的基因。 2.核酸序列相同: 组蛋白基因家族 多拷贝基因形成的基因簇,rRNA、tRNA、组蛋白基因家族。 非洲爪蟾的5SRNA基因结构 5SRNA基因 非转录空隔区 3.核酸序列高度同源 生长激素(GH)与绒毛膜生长催乳激素(CS) 氨基酸序列比对 217 4.编码产物的功能或功能区相同 (四)假基因(pseudogene,Ψ) ? G? A? ? ? ??2 ??1 Alu 10 kb 珠蛋白基因簇中的假基因 与有功能的基因相似,不表达基因产物的基因。 1.线性双链DNA病毒 早期蛋白(E) 晚期蛋白(L) 腺病毒 adenovirus E1A E1B E3 E4 E2B E2A 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% L2 L3 L4 L5 L1 IT
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