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1:[论述题] 论述题 1、何谓限制性核酸内切酶?写出大多数限制性核酸内切酶识 DNA 序列的结构特点。 答: 限制性核酸内切酶(RE)是由细菌产生的一类能特异识别双链DNA中的特定碱基序列,并在识别位点切割磷酸二酯键的核酸内切酶(简称限制酶)。限制酶的识别和切割位点通常是4~8个bp长度且具有回文序列的DNA片段,主要产生5′突出、3′突出的黏性末端或平端。当一个样本DNA被一个特定的限制酶切割后,可以产生一批相同碱基序列的DNA片段,进而可以用于基因重组、克隆、核酸分子杂交与序列分析 2、什么是Western印迹?它与Southern印迹有什么不同? 答: Western印迹是将蛋白质经电泳分离后从凝胶中转移到固相支持物上,然后用特异性的抗体进行检测。它与Southern的不同在于探针的性质不同,在Western印迹中使用的探针是抗体(蛋白质)。 3、什么是基因组文库(genomic library)?构建基因组文库,涉及哪些基本过程?它同遗传学上的基因库有什么不同? 答: 基因组文库是用基因工程的方法,人工构建的含有某一生物基因组DNA的各种片段 的克隆群。一般以改造的噬菌体DNA或黏粒作为载体,包括下列过程:(1)高分子量染色体DNA的制备;(2)体外重组连接;(3)包装蛋白的制备;(4)重组体的体外包装;(5)将重组DNA导人寄主细胞;(6)筛选。基因组文库同遗传学上所讲的基因库是完全不同的概念。基因库(gene pool)是指在进行有性生殖的某一群体中,能进行生殖的个体所含总的遗传信息。在基因组文库的构建中,由于使用的载体不同,分为噬菌体载体和黏粒载体构建的基因组文库、YAC文库、BAC文库等。 4、分析比较琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳的异同点? 答: 琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。琼脂糖凝胶电泳分离 DNA 片断大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从 200bp 至近 50kb 的 DNA 片段。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。聚丙烯酰胺分离小片段 DNA (5-500bp)效果较好,其分辨力极高,甚至相差 1bp 的 DNA 片段就能分开。聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的 DNA ,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行 DNA 电泳。 5、如果知道某一基因的功能及其相应的蛋白质的氨基酸序列组成,可以通过何种方法克隆该基因? 答: 可以通过合成核苷酸探针或设计简并PCR引物从cDNA文库或基因组文库中筛选。或者利用相应的抗体从cDNA表达文库中筛选相应的克隆。 简答题 1、常用的工具酶有哪些?其主要用途是什么? 答: (1)限制性核酸内切酶:识别并特异切割DNA碱基序列;(2)DNA polⅠ:催化缺口平移,制备高比度DNA探针;(3)Klenow片段:合成cDNA第二条链,补齐或标记双链DNA3′端;(4)TaqDNA聚合酶:DNA体外扩增(PCR);(5)逆转录酶:催化合成cDNA;(6) T4DNA聚合酶:聚合补平或标记DNA平末端或3′凹端等;(7)DNA连接酶:催化2条DNA链之间形成磷酸二酯键;(8)大肠杆菌DNA连接酶: 应用于黏端DNA或切口间连接;(9)T4DNA连接酶:应用于黏性或平末端DNA的连接;(10)末端脱氧核苷酸转移酶:给载体或cDNA加上互补的同聚尾、加标记物;(11)碱性磷酸酶:防止载体自身连接、32P标记5′端;(12)T4多核苷酸激酶:5′端磷酸化、5′端标记放射性核素。 2、重组DNA技术常包括哪些基本步骤: 答: (1)分离制备目的基因――分”;(2)切割目的基因和载体――切”;(3)目的基因与载体的连接――接”;(4)将重组DNA导入宿主细胞――转”;(5)筛选并鉴定含重组DNA分子的受体细胞克隆――筛”;(6)克隆基因在受体细胞内进行复制或表达――表”。 3、常用的目的基因的获取方法有哪些? 答: (1) 制备基因组文库;(2) 构建cDNA文库;(3) PCR扩增目的基因;(4) 人工合成DNA技术。 4、常用的目的基因与载体的连接方法有哪些? 答: ⑴ 黏性末端连接:将靶基因片段和载体DNA经相同的限制酶分别切割,使它们两端产生相同的黏性末端。然后经黏性末端碱基配对,再经DNA连接酶作用,共价连接成新的重组DNA分子;⑵ 平头末端连接:将平末端的DNA分子在T4DNA连接酶催化下,使DNA分子的3′OH和5′P进行共价结合; ⑶ 人工接头法: 是指利用人工接头加在平端DNA片段的两端,然后用相应限制酶切割人工接头以产生黏性末端,再与带相同黏性末端的载体相连;⑷ 同源多聚尾连接法:在末端脱氧核苷酸转移酶
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