大黄鱼、鲵鱼及美国红鱼线粒体DNA的Cyt.PDFVIP

第4卷第 3期 南 方 水 产 Vol_4．No．3 2008年 6月 SouthChinaFisheriesScience Jun．，2008 大黄鱼、鲵鱼及美国红鱼线粒体 DNA的Cytb基因序列比较 李鹏飞，周永东，徐汉祥 (浙江省海洋水产研究所，浙江 舟山316100) 摘要：利用PCR技术对大黄鱼 Pseudosciaenacrocea、鲵鱼 Scioenopsocellatus和美国红鱼Miichthysmiiuy线粒体 DNA的细胞色素b (Cytb)基因片段进行了扩增，PCR产物直接测序，分别获得大黄鱼和美国红鱼 1140bp的 序列 ，鲵鱼 1125bp的序列。通过对 3种鱼的Cytb序列的比对分析，得出3种鱼序列的相似性为91．49％；分 析了3种鱼序列的碱基组成及碱基变异情况，发现3种鱼的序列差异明显，碱基替换较多，可以将 Cytb基因作 为种间分子鉴定或更高分类界元遗传分析的分子标记 ；计算了3种鱼序列的遗传距离并构建了系统树，结果显 示，鲵鱼与美国红鱼的遗传距离较近。 关键词：大黄鱼 ；鲵鱼；美国红鱼；线粒体 DNA；Cytb基因 中图分类号：Q523．8；Q959．483 文献标识码：A 文章编号：1673—2227一 (2008)03—0043一o5 Sequenceanalysisonmitochondrial(mtDNA)cytbgenesin Pseudosciaenacrocea，M iichthysmiiuy and Sciaenopsocellatus LIPengfei，ZHOU Yongdong，XU Hanxiang (MarineandFisheriesResearchInstituteofZhejiangProvince，Zhoushan316100，China) Abstract：Thecompletesequencesofcytochromeb(Cytb)genesinPseudosciaenacroceaandScioenopsocellatus，andthepartial sequenceofcytochromeb(Cytb)geneinMiichthysmiiuywereamplifiedusingPCRtechnology．ThePCRproductsweresequenced directly．1140bpfragmentsofCytbgenesinP．croceaandS．ocellatus，and 1125 bpfragm entofCytbgeneinM ．miiuywereob— tained．Comparingobtainedsequences，thecomparabilitysimilarityofthreesequenceswas91．49％．Informationofthebasecomposi— tionandthemutationsiteswereobtained．Thedifferenceofthreesequenceswasobvious．Theresultscontributednotonlygeneticdata toeconomicutilizationofthreespeciesbutalsoscientificbasistoanalysisofgeneticdiversityinChinaSea．Moreover，molecular phy— logenetictreeofthe bDNA sequencesinthethreespecieswasreconstructedwiththeNJmethodbasedontheinheriteddistance andtheresultshowedthattheinheriteddistancebetweenthe miiuyandtheS．ocellatuswassmal1． Keywords：Preudosciaenacrocea