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第一章 蛋白质的生物合成--翻译 Protein Biosynthesis ---Translation System 前 言 第一节 参与翻译过程的物质与功能 二、 tRNA的结构与功能 (一)tRNA的二级结构 (二)tRNA的三级结构 所有的tRNA的三级结构经X-ray 衍射发现,都呈L形,见下图。 三、? 核糖体的结构与功能 (一)核糖体的组成与结构 第二节 肽链合成的起始、延伸和终止 一、氨基酸的激活与氨酰基-tRNA的合成 2. 氨酰基-tRNA合成过程中的校正(proofreading)机制 二、原核生物蛋白质翻译过程 (一)翻译的起始 1. 30S起始复合物的形成 30S起始复合物包括fMet-tRNA、mRNA与30S小亚基结合。 这一过程是在起始因子和GTP参与下完成的。 原核起始因子有3种:IF1,IF2和IF3。 IF1:IF1是一个小的碱性蛋白,它能增加IF2和IF3的活性。 IF1与16S rRNA的结合位点在A位点 。另外,IF1具有活化GTP 酶的作用。 IF2:具有很强的GTP酶活性,在肽链合成起始时催化GTP 水解。功能是生成IF2?GTP?fMet-tRNA三元复合物,在IF3存在 下,使起始tRNA与核糖体小亚基结合。 IF3:IF3与16S rRNA相互作用位点在P位点附近。IF3能 通过促使mRNA的S-D序列与16S rRNA的3’-端碱基配对,让核 糖体识别mRNA上的特异启动信号,又能刺激fMet-tRNAf与核 糖体结合在AUG上。 mRNA 和fMet-tRNA 结合于IF·30S·GTP聚合体上。在结合时,fMet-tRNA与IF2-GTP复合物紧密接触。 在核糖体小亚基上的16S rRNA 3’-端有一段顺序: 5’-PyACCUCCUA-3’。 其中Py可以是任何嘧啶核苷酸。它可与mRNA中的AUG上游约10个碱基处有一段富含嘌呤的序列AGGA或GAGG(Shine-Dalgarno顺序)互补。正是由这样的配对将AUG(或GUG,UUG)密码子带到核糖体的起始位置上 。 fMet-tRNA 与小亚基上的A位点结合。 2. 70S起始复合物的形成 30S起始复合物一旦完全形成后,IF3即释放出来。50S大亚 基参加进来,并引起GTP水解和释放其它两个起始因子,最后 的复合物称为70S起始复合物。 (二)多肽链的延伸、移位循环 (三)多肽链合成的终止 三、真核生物蛋白质的生物合成 蛋白质变性: 天然态(折叠态) 变性态(伸展态) 体外蛋白质的复性: U I N (一)体外蛋白质折叠的机制 体外蛋白质的折叠可能是始于疏水坍塌(hydrophobic collapse),或始于转角(turn),或始于共价键相互作用(如二硫键的形成)。在折叠早期,可能这三种方式联合起作用。之后,可能沿着有限的多途径形成中间态(熔球态)。这个过程是快速的。最后再由中间态进入天然态,此过程比较慢,是折叠反应的限速步骤。 (二)体内蛋白质的折叠 体内环境复杂;需要助折叠蛋白 (folding helper)的参与,从而降低 了折叠的错误,提高了效率;在翻译 结束之前即开始(邹氏学说)。 助折叠蛋白: 1. 酶 :蛋白质二硫键异构酶;肽酰脯氨酰顺反异构酶。 与新生肽链的折叠密切相关,加速蛋白质折叠过程。 2. 分子伴侣:细胞内帮助新生肽链正确组装,成为成熟蛋 白质,而本身却不是最终功能蛋白质分子的组成成分的分子, 都称为分子伴侣(molecular chaperone)。 分子伴侣(chaperonin)家族: 二、蛋白质的修饰 (一)末端氨基的脱甲酰化和N端蛋氨酸的切除 对起始氨基酸的修饰。 (二)多肽链的水解断裂: 胰岛素的修饰过程。 Prepro-insulin Pro-insulin insulin 第四节 蛋白质的跨膜运输与定位 一、蛋白质转位的途径 1. ?共翻译(cotranslation)转位 Proteins that are localized cotranslationally associate with the ER me
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