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olc1基因在吸烟致癌过程中相关作用机制的研究肿瘤学基础专业论文
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文 目录
2.小鼠香烟暴露及样本收集 114
3.总RNA样品的制备与鉴定 .115
4.基因芯片检测mRNA表达谱 ..11 6
5.芯片数据分析 11 9
6.实时荧光定量PCR分析 ..119
7.分子生物学实验方法 121
8.细胞生物学方法 124
9.免疫组织化学分析 126
全文总结 127
参考文献 129
本学位研究课题受以下基金资助 137
至殳谢 ..1 38
独创性声明 1 39
学位论文版权使用授权书 139
万方数据
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文 图表索弓
图表索5l
图1.1 美国2016年内恶性肿瘤预计新发病例和死亡病例前10位 ..1
图1.2 吸烟导致肺癌发生过程分子事件示意图 ..2
图1.3 OLCl基因在吸烟致癌过程中作用研究策略 .11
图2.1 非小细胞肺癌肿瘤组织OLCl的免疫组化染色代表性图像 13
图2.2 ESCRT复合体的组成及其相互作用 18
图3.1 CSC处理所致肺癌细胞A549和H1299的细胞毒性 22
图3.2 CSC处理上调肺癌细胞中OLCl蛋白水平 23
图3.3 NNK、MCA和B[a]P处理不影响细胞OLC 1蛋白水平 ..24
图3.4 经CSC处理24小时后两种肺窟细胞的总mRNA榭及其变懒 25
图3.5 A549细胞经CSC处理后差异表达基因显著富集的KEGG通路 28
图3-6 H1299细胞经CSC处理后差异表达基因显著富集的KEGG通路 .30 图3.7 构建稳定过表达OLCl的肺癌细胞株 3 1
图3.8 稳定僦OLCl后两种啼蝴盹总mRNA榭及其变懒 32
图3-9 A549细胞稳定过表达OLCl后差异表达基因显著富集的KEGG通路 ..34
图3.10 H1299细胞稳定过表达OLCl后差异表达基因显著富集的KEGG通路 一3 7
图3.1 1 经(SC处理24 d州后两f幌氯交婊达OLCl肺寤黜总mRNA表齿觏赠转眦趋张38
图3.12 A549/OLCl细胞经CSC处理后差异表达基因显著富集的KEGG通路 41
图3.13 H1299/OLCl细胞经CSC处理后差异表达基因显著富集的KEGG通路 ..43
图3.14 CSC她里燃伽,,或砖移非黼删9细撼攀蒴弦葬表逸魏蚕慨览 44
图3.1 5 CSC处理、过表达OLCl,或两者共同作用于A549细胞诱导的差异表达基因形成 I拘pathwaynetwork ..... ......... . 45
图3一16 CSC处理A549/OLCl细胞的差异表达基因减去CSC处理的A549细胞的交集差异
表达基因后的193个基因,在两者中的表达趋势 47 图3.17 CSC处理A549/OLCl细胞的差异表达基因减去与CSC处理的A549细胞的交集差 异表达基因后的基因集(193个)的GO富集分析 .48
图3.1 8 候递烩趔耋因在A549/OLCl细胞mRNA表齿普起始R钵中盼础步验证 .49
图3.19 A549/OLCl细胞中特异差异表达的“免疫/炎症/癌变相关”基因 51
图4.1 OLCl基因工程小鼠鉴定示意 .63
图4.2 C57BL/6J/OLCl小鼠与WT小鼠肺组织差异表达基因聚类分析 64
图4.3 C57BL/6J/0LCl小鼠与WT小鼠肺组织差异表达基因GO富集 65
图4.4 C57BL/6J/OLCl小鼠与WT小鼠差异基因显著富集的KEGG通路 .66 图4.5 C57BL/6J/OLClsi小鼠与WT小鼠肺组织差异表达基因聚类分析 67
IV
万方数据
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文
北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文 图表索弓
图4.6 C57BL/酬G吧a戚小鼠与Wr小鼠肺组织差异表达基因GO富集 68
图4.7 C57BL/6J/OLClsi小鼠与Wr小鼠差异基因显著富集的KEGG通路 69
图4.8 WT小鼠短期香烟烟雾暴露后肺组织差异表达基因聚类分析 .71
图4-9 WT小鼠短期香烟烟雾暴露后肺组织差异表达基因GO富集 .72
图4.10 Ⅵ小鼠短期香噙氍雾厮差异表’媾因显著粼KEGG通路 ..73
图4.11 C57BI脚,C1小鼠j彭瓣剽琐瞎镙霜后肺组织差幕毒哒基因聚类分析 74
图4.12 C57BU6J/OLCl小鼠短期香烟烟雾暴露后肺组织差异表达基因GO富集 75
图4.13 C57BU6J/OLCl小尉面豫孰驰灞暴露屁封霸耽璧眍煜著粼KECK3通路 ..76
图4.14 C5’7BI/6哥侈£Clsi小鼠短期香炬晦甥霭强靳动秘彤霓壶异表达基因聚类分析 77
图
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