谱系分析在生态学中的应用.pptxVIP

谱系分析在生态学中的应用－原理、实例和实现;提纲;谱系 phylogeny;;根结点(root)：该谱系树所包含的所有物种（或类群）的共同祖先 末端节点(tip, terminals, leaf )：现存物种 中间结点(node)： 表示分化事件，或其后代的最近共同祖先 枝(branch)： 连接相邻两个结（节）点的线 分枝(clade)：谱系树的一部分，包括由一个共同祖先衍生的所有后代;branch;; ;;生态学中常用的谱系分析; 谱系多样性;群落谱系结构;性状保守性与相关性分析;生态学谱系分析怎么做？;创建谱系树;((((((((((((((((((((((((((((((Alnus_mandshurica,Alnus_sibirica)alnus,(Betula_ermanii, Betula_platyphylla)betula)betuloideae,((Corylus_mandshurica)corylus)coryloideae))betulaceae))), …… ericales)ericales_to_asterales)asterids)))))core_eudicots)trochodendrales_to_asterales)sabiales_to_asterales)eudicots)ceratophyllales_and_eudicots)poales_to_asterales)magnoliales_to_asterales)austrobaileyales_to_asterales)nymphaeales_to_asterales)angiosperms)seedplants)euphyllophyte[NOTE: 9 taxa not matched: aceraceae/acer/Acer_ginnala, aceraceae/acer/Acer_mandshuricum, aceraceae/acer/Acer_pictum, aceraceae/acer/Acer_pseudo-sieboldianum, aceraceae/acer/Acer_tegmentosum, aceraceae/acer/Acer_triflorum, aceraceae/acer/Acer_ukurunduense, tiliaceae/tilia/Tilia_amurensis, tiliaceae/tilia/Tilia_mandshurica, ]; 注：有物种不匹配，可能的原因：a，拼写错误；b，科属的关系变化，如Acer在APG III系统中属于无患子科（ Sapindaceae ）需修改后重新匹配。;用Treeview 打开;;Phylocom 4.2;Phylocom 使用方法：;查看结果;R＋Package“picante”;Thank you!