汉族人群银屑病和强直性脊柱炎易感位点的相关性分析word格式论文.docxVIP

引物设计及合成…………………………………Sequenom实验日程安排…………………………2 Plink1.03软件进行统计分析……………………343．结果…………………………………………………………………354．讨论…………………………………………………………………415．结论…………………………………………………………………436．参考文献……………………………………………………………44附录……………………………………………………………… 47致谢……………………………………………………………………………………49课题综述…………………………………………………………………51英文缩略词表缩写词AS英文全称ankylosingspondylitis中文名称强直性脊柱炎GWASGenome-wideassociation study全基因组关联分析OMIMOnline MendelianInheritancein Man人类在线孟德尔遗传SNPHWESingle nucleotide polymorphismHardy-Weinberg单核苷酸多态性基因平衡定律LDLinkagedisequilibrium连锁不平衡ODOptical density吸光度OROdds ratio优势率EDTAEthylenediaminetetraacete乙二胺四乙酸PCRPolymerase chain reaction聚合酶链反应MAFMinor allele frequency最小等位基因频率CIConfidenceinterval置信区间HapMapHGPHuman HaplotypeMapHuman Genome Project人类单体型图人类基因组计划SDstandarddeviation标准方差中文摘要汉族人群银屑病和强直性脊柱炎易感位点的相关性研究研究背景：银屑病（psoriasis, OMIM﹟177900）是一种常见的慢性炎症性皮肤病，以红斑、鳞屑为主要临床特征，具有明显的复发特性。据流行病统计结果发现，该病可发生于各人种，但是不同种族发生率有明显的差异。遗传因素和免疫介导在本病发生过程中扮演了重要角色，而且多种免疫调节剂对此病疗效显著，因此银屑病也被认为是一种自身免疫性疾病。13 个银屑病易感位点已被OMIM 收录，为：PSORS1，PSORS2，PSORS3，PSORS4，PSORS5，PSORS6，PSORS7，PSORS8，PSORS9，PSORS10，PSORS11，PSORS12 和PSORS13，分别位于6p21.3、17q25、4q、1q21、3q21、19p13、1p、16q、4q31、18p11、5q31.1、20q13 和6p21。一些发现也证明银屑病和其他疾病如自身免疫系统疾病，如强直性脊柱炎（Ankylosing spondylitis, AS）、克罗恩肠病（Crohn’s Disease, CD）等，有着共同的易感基因。HLA-DR7 在英国与幼年型AS 有关，而其同时也与Ⅰ型银屑病相关。基因IL23R 和ERAP1 也已被证明同时与银屑病和AS 相关，而且临床上10%的AS 患者同时患有银屑病。病因上，二者也有一致性。AS是一种慢性进行性炎症性以脊柱关节受累为主的免疫性疾病，大量研究显示AS 是一种遗传病。遗传因素在其发病过程中起主导作用,相关基因除HLA-B27 外,尚有HLA区域内及HLA区域外的其他基因参与，已发现的基因和位点IL23R、ERAP1、rs4672495（2p15）、rs4333130（4q21）、rs2242944(21q22)、rs4552569（5q14.3）和非同义核苷酸多态性（non-synonymous single nucleotide polymorphism, nsSNP) rs4077515（9q34.3）和位于KIF21B的rs2297909（1q32）。国际单体图型计划（Human HaplotypeMap,HapMap）的完成和廉价高效的高通量基因分型技术的出现，为全基因组水平搜寻复杂疾病易感基因的方法即全基因组关联研究（Genome-wideassociation study, GWAS）提供了支撑，全基因组关联研究（GWAS）在常见复杂疾病的遗传学研究中有更高的效力。为了更好地揭示银屑病和AS 之间的关系，也为了更好地揭示银屑病的遗传学依据，本研究以欧美人群AS 患者全基因组关联分析（GWAS）数据为基础，在中国汉族银屑病患者中（2208 病例和2208 对照）进行验证。目的：研究欧美人群强直性脊柱炎易感位点在中国汉族人群银屑病中的作用，搜寻两种疾病之间的遗传共性和异质性。方法：从欧美人群强直性脊柱炎患者的全基因组关联分析（GWAS）发现的易