arms2htra1基因与年龄相关性黄斑变性的关联分析word格式论文.docxVIP

ARMS2/HTRA1 基因与年龄相关性黄斑变性的关联分析摘要目的：探讨宁夏地区人群ARMS2/HTRA1基因的多态性与年龄相关性黄斑变性的相关关系。方法：采用病例对照关联分析的方法，收集宁夏地区447例AMD患者作为病例组，以及906 例拟行白内障手术者（排除其他眼部疾病）作为对照进行研究。抽取所有受试者外周静脉血6ml，并提取全基因DNA样本。基于HAPMAP数据库，选取ARMS2/HTRA1基因上的13 个标签SNPs（rrrs2736911、rs2736912、rs2248799、rs2253755、rs2300435、rrrrs2268356、rs2672585、rs2736914），对所有SNPs进行基因分型，分析各SNP与AMD之间的相关性。利用haploview4.02软件分析ARMS2/HTRA1 基因的连锁不平衡区块，并分析区块内单体型与AMD之间的关联性。结果：本研究分析的13个SNPs 的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。关联研究结果显示：经校正年龄及多重检验校正P值后，rrs2248799、rs2253755、rs2736911、rs2736912、rs2736914 的等位基因频率分布与AMD遗传易感性有强关联性，P值均≤0.005，其中以rAMD关联效应最强（OR=2.599；95%CI=2.180-3.099）。在加性模型及显性模型下，该6个SNPs 的基因型分布亦与AMD遗传易感性相关联，通过校正后P＜0.05。此外，13 个SNPs 共可构建成3个连锁不平衡区块，其中Block1（rrs2736912）区块内3种单体型TC、GC、GT与AMD显著关联（P＜0.000）。Block2（rrs2753755-rs230043）内的AGG与AAG型在病例组与对照组间有统计学差异，但经100000 次置换检验后，仅AGG 型在两组间有统计学差异（P＜0.000）。结论：ARMS2/HTRA1基因的rs100490924、rs2248799、rs2253755、rs2736911、rs2736912、rs2736914位点的多态性与宁夏地区人群AMD的发生存在相关性。rrs2736912位点构成的3 种单体型TC、GC、GT与AMD 显著关联。关键词：老年，黄斑变性，年龄相关性黄斑病变易感因子2/基因学，高温必需因子A-1/基因学，基因多态性IAbstractObjectives：ToinvestigatetheassociationbetweenthevariantsofARMS2andHTRA1 gene and therisk ofAMD in Ningxia population.Methods：Fourhundredandforty-sevenpatientswithAMDandninehundredandsixcontrolswererecruitedinNingxiaEyeHospitalformJanuary2011toJuly2014.All individualsunderwentcomprehensiveeyeexaminationsandgenomicDNAwasprepared fromperipheralblood.Thesinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)of13susceptibilityloci inARMS2/HTRA1weregenotyped.Thedifferencesofgenotypedistributionofalleleand haplotypefrequencieswerecomparedbetweenpatientsandcontrolsandtherelationshipof genotypedistributionwithAMDwasevaluatedbyusingplink.Measuresoflinkage disequilibrium was carried out byHaploview.Results：All thegenotypes met Hardy-Weinberg equilibrium. SixSNPs werefound to bedifferentinthegenotypicdistributionsandallelefrequenciesbetweenpatientsandnormal controlsaftercorrection(allatP≤0.05),i