并行集群系统概述.pptVIP

Slurm---? Semilar as ssh/rsh OpenMPI does not support VAPI * * * * * * * * * * * Intel Compiler 获取Intel Compiler的安装包 C/C++ Compiler为：l_cc_*.tar.gz Fortran Compiler为：l_fc_*.tar.gz tar解压 tar xzvf l_cc_*.tar.gz (l_fc_*.tar.gz） 进入相应的解压目录 执行./install.sh，并根据提示信息选择相应选项 1.license绝对路径，回车 2.选择1.Intel(R)C++Compilerfor-bitapplications,Version9.0回车 3.根据英文内容，按回车然后按提示输入accept，安装到默认的目录：/opt/intel_cc_90 即可 4.安装完毕后按提示输入‘x’即可退出安装环境 设置环境变量 #vi /etc/profile 添加：export PATH= /opt/intel_fc_90/bin$PATH export PATH= /opt/intel_cc_90/bin$PATH（以上两个路径 根据安装设置的路径定） 设置库环境变量：vi /etc/ld.so.conf,添加intel库绝对路径，然后执行 ldconfig * * MPI for intel Compiler 将openmpi解压后，进入openmpi目录执行： #./configure –with-prefix=/public/soft/ompi133-intel CC=icc CXX=icpc FC=ifort F77=ifort F90=ifort #make #make install 设置环境变量相关 #vi profile 添加： export MPICH_ROOT=/ public/soft/ompi133-intel export $PATH=$MPICH_ROOT/bin:$PATH export $MANPATH=$MPICH_ROOT/man:$MANPATH 执行#source /etc/profile即可 * * 应用软件调试 解压：tar 命令 准备：读取README，INSTALL文档，执行./configure --help 配置:./configure –prefix=… conf.log 编译:make make.log（选项） 安装：make install install.log * * 一般软件的安装步骤 应用软件调试 性能分析工具intel vtune 并行调试器PGDBG，totalview * * 软件调试的工具 应用软件调试 随时记录运行日志 执行时将正确和错误输出都导入到一个文件中 mpirun –np $NP –hostfile ./ma a.out a$(date).log 软件的输入是否正确 找个benchmark来测验下 版本不匹配 运行核数不正确 软件的版本问题？ 是否支持并行 支持哪种并行，MPI还是OpenMP,或者PVM 软件的扩展性？ 运行进程从小到大试试看， 运行命令是否正确？ 程序是否需要输入， 不同的MPI不同的执行方式，耦合模式的执行方式 o * * 软件运行出错后怎么办？ 集群使用建议 使用Linux命令时，可以通过man手册获得相关命令详细使用说明 执行命令出错时，可通过输入错误关键词在网络上获得相关信息，（同样的错误别人肯定也经历过） 编译软件出现编译器相关错误时考虑换编译器，或者升级或降低软件版本 安装软件时，首先查看其手册,如INSTALl,Readme等，然后可查看Makefile或makefile检查其依赖的专业或系统库，确保正确的路径被添加，同时检查makefile依赖的其他文件，确保正确的编译环境。 可借鉴别人的成功编译环境，（包括软件版本，编译器，MPI，操作系统等） 最后，实在未见过的错误最好去google下 * * 谢谢！ * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 并行集群系统概述 曙光信息产业（北京）有限公司 解决方案部 * * 目录 集群介绍 集群工具 系统命令 集群调试 常用软件 * * 集群介绍 Cluster(集群) 集群(cluster)就是一组计算机，它们作为一个整体向用户提供一组资