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Gaussian03技术讲座 分子坐标、基组选择和常见出错处理 张 祥 北京宏剑讯科软件技术有限公司 G03W 输入界面 基本输入命令: LinK 0 命令 %chk=XXX %MEM=XXXX MB GB MW or or %RWF=loc1,Size1,loc2,Size2, ………,locN,-1 %SCR=XXX.scr %D2E=xxx.d2e %INT= %Kjob L301 (n) %Nosave %nproc=n %nproclinda=n %nprocshared=n 分子描述 自旋多重度 分子结构 电荷 由分子总电子自旋 分子坐标 整个分子体系 在Z轴分量必须是 (内坐标或直角坐标) 所带净电荷 正数或半整数限制 连接性或其他修饰说明 如何确定分子的自旋多重度 自旋多重度是看在有外加磁场情况下,体系 可以稳定存在的微观状态数: a. 在有磁场 存在下,分子的电子总自旋在Z轴上的分量 为整数或半整数时,才能稳定存在; b. 邻近 的两个稳定状态之间Z周分量应该相差1。 因此,它和体系的总电子自旋S有关: 自旋多重度=2S+1 1个和2个单电子时自旋多重度的确定 容易知道,闭壳层体系的自旋多重度为1。具有一个单电子的体系自旋多重 度为2 。余下类推。 成对电子对自旋多重度没有贡献。 几个自旋多重度判断的例子 1. 一、二周期原子的基态的自旋多重度判断: 原子: H, He, Li, Be, B, C, N, O, F 基态电子排布:1s1 2 1 2 2 1 2 2 2 3 2 4 2 5 1s 2s 2s 2s 2p 2s 2p 2s 2p 2s 2p 2s 2p 未成对电子数: 1 0 1 0 1 2 3 3 1 2.几个过渡原子的自旋多重度 2 5 Mn 4s 3d 5个自旋平行单电子 S=2.5 自旋多重度为6; 2 6 Fe 4s 3d 4个自旋平行单电子 S=2, 自旋多重度为5; 3. Fe 的自旋多重度有许多可能,哪个是基态需要根据实验或计算 2 确定。 下面是其中一种可能的成键情况: 当左右两个Fe原子的未成对单电子自 旋都平行时,S=4,自旋多重度是9; 左边Fe单电子自旋向上,右边的自旋 向下时,自旋多重度为1。 基本输入命令:Job_Command Line 输入分子结构坐标的来源 1、自建: a. 手写内坐标和混合内坐标 b. 用分子作图软件创建 1. ChemDraw 2. GaussView 3. Molden 2、分子结构的实验数据或数据库 a. 晶体结构数据 1. x-ray单晶测量 2. 中子衍射测量 3. Cambridge 晶体结构数据库 Cambridge Structural Database (CSD)

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