第3讲 基因的效应 群体与数量遗传学 教学课件.pptVIP

群体与数量遗传学 第三讲 基因的效应 基因的效应 基因的累加效应 一、群体的平均值 二、基因的平均效应 三、育种值 基因的非累加效应 四、显性效应 五、互作效应 基因效应的方差协方差 一、群体平均值 考虑一个位点，基因(配子)频率分别为pA1 :q A2。 当群体平衡时，基因型及基因型频率分别为： p2（A1A1）: 2pq(A1A2) : q2(A2A2) 设： A1A1 、A1A2、A2A2的基因型值 分别为：a, d, -a 一、群体平均值 1、群体基因型值的平均数 基因型 频 率 基因型值 A1A1 p2 a A1A2 2pq d A2A2 q2 -a 群体基因型值的平均数μ μG =p2×a+ 2pq×d+ q2×(-a) =a(p-q)+2pqd 当设计多个位点时 假设：奶牛的产奶量 基因型频率与基因频率 R1 R1频率=4/25=0.16 R1 R2频率=12/25=0.48 R2 R2频率=9/25=0.36 R1 频率 p=4/25+ 6/25=0.4 R2频率 q=1-0.4=0.6 群体均数 以绝对值表示 表型均数μP ： =(5300+5100+……+4850+4650)/25=4986kg 基因型值： R1 R1 =(5350+5100+4900+5100)/4=5100kg R1 R2 =(5050+5250+……+4850+5250)/12=5050kg R2 R2 =(5050+5050+……+4850+4650)/9=4850kg 基因型值均数μG ： =0.16×5100+0.48×5050+0.36×4850=4986kg 按R1 R1 、 R2 R2的中点M为0表示 基因型值： R1 R1 =5100kg R1 R2 =5050kg R2 R2 =4850kg 以M＝(5100+4850)/2=4975为原点（0点）算起： a=5100 －(5100+4850)/2=125 kg d=5050-4975=75kg 基因型值均数： μG =a(p-q)+2pqd =125*(0.4-0.6)+2*0.4*0.6*75=11 μG＝4986 ＝ μG ＋ M 二、基因的平均效应 1、基因A1的平均效应α1 父母是把基因而不是基因型传递给后代； 基因A1的平均效应α1是从一个亲本获得A1基因的个体距离群体平均数的平均离差。 带A1基因配子 × 群体中的配子 pA1 : qA2 后代个体基因型分布： pA1A1:qA1A2 A1A1基因型值=a A1A2基因型值=d 后代个体基因型值＝pa+qd 基因A1的平均效应α1 = pa+qd- μG =pa+qd-[a(p-q)+2pqd] =q[a+d(q-p)] 二、基因的平均效应 1、基因A1的平均效应（α1） 2、基因A2的平均效应（α2） 基因A2的平均效应α2是从一个亲本获得A2基因的个体距离群体平均数的平均离差。 带A2基因配子 × 群体中的配子 pA1 : qA2 后代个体基因型分布： pA1A2 : qA2A2 A1A2基因型值=d A2A2基因型值=-a 后代个体基因型值＝pd-qa 基因A2的平均效应α2 = pd-qa - μG = pd-qa -[a(p-q)+2pqd] =-p[a+d(q-p)] 二、基因的平均效应 1、基因A1的平均效应（α1） 2、基因A2的平均效应（α2） 3、基因替代的平均效应α 当我们把群体中的A2基因随机地变为A1基因时所产生的变化。 群体中A2基因的来源:2pq(A1A2) : 2q2(A2A2)=p:q A1A2 ? A1A1 d ?+a 概率 p A2A2 ? A1A2 -a ?d 概率 q 基因A1替代A2的平均效应α=p(a-d)+q(d+a) = a+d(q-p) 二、基因的平均效应 1、基因A1的平均效应α1=q[a+d(q-p)] 2、基因A2的平均效应α2=-p[a+d(q-p)] 3、基因替代的平均效应α= a+d(q-p) α1=q α α2=-p α α =α1 -α2 基因的平均效应是基因型值及基因频率的函数 二、基因的平均效应 1、基因A1的平均效应α1=q[a+d(q-p)] 2、基因A2的平均效应α2=-p[a+d(q-p)] 3、基因替代的平均效