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启动子与转录起始
白雪 李晓莲 种工二班 3.3.2 启动子区的识别 启动子的功能既受DNA序列的影响,又受其构象的影响,推测RNA聚合酶并不直接识别碱基本身,而是通过氢键互补的方式加以识别。 (类似于酶与底物的结合) 3.4.4 -10区与-35区的最佳距离 原核生物中,-10区与-35区之间的距离大约是16-19bp,小于15或大于20都会降低启动子活性。 间隔的序列不严格,但是距离的大小可能是决定启动子强度的因素之一。保持适当距离对RNA聚合酶的功能是必要的。 保持启动子这两段序列以及它们之间的距离十分重要,否则就会改变他所控制基因的表达水平 间隔序列对启动子功能相对并不十分重要;但在90%的启动子中,两序列之间的距离约17bp,或者说相隔2个螺旋左右,因而这两个位点大致在DNA双螺旋的同一侧。 不同启动子起动效率不同,分为强启动子(1-2sec启动1次转录)和弱启动子(至少10min才启动1次转录)。 3.4.5 增强子及其功能 * * 3.4.1 启动子区的基本结构 3.4.2 启动子区的识别 3.4.3 RNA聚合酶与启动子区的结合 3.4.4 -10区与-35区的最佳间距 3.4.5 增强子及功能 3.4.6 真核生物启动子对转录的影响 3.4.7 转录的抑制 主要内容: ★启动子:是一段位于结构基因5’端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性。 ★转录单元:从启动子到终止子的DNA序列 ★转录起始位点:与新生RNA链第一个nt相对应DNA链上的碱基。通常为嘌呤 DNA 启动子 转录起点 -1+1 终止子 编码链 模板链 转录区域 RNA 转录 3.4.1 启动子区的基本结构 启动子区的结构特点 ★Pribnow 实验( Pribnow box)P76图 -35区 -10区 …..T85T83G81A61C69A52…T89A89T50A65A100 YANT/AYY 真核基因 ★TATA区:Hogness box(类似原核的Pribnow box) - 60 - 40 上游元件 -35区 间隔区 间隔区 转录起始位点 -10区 -30 +1 多种不同的调控元件 5’ 3’ TATAAA TATA区 第一位转录碱基 YANT/AYY 3.4.3 RNA Pol 与启动子区的结合 ??? 1981年Benerji在SV40DNA中发现一个140bp的序列,它能大大提高SV40DNA/兔β—血红蛋白融合基因的表达水平。它位于SV40早期基因的上游,由两个正向重复序列组成,每个长72 bp。目前发现的增强子多半是重复序列,一般长50bp,通常有一个8~12bp组成的“核心”序列,如SV40增强子的核心序列是5’— GGTGTGGAAAG—3’。 增强子或强化子:能强化转录起始的序列。 不是启动子的一部分,但能增强或促进转录的起始,除去这两段序列会大大降低基因的转录水平,保留其中一段或取出插至DNA的任何部位,就能保持基因的正常转录。 增强子很可能通过影响染色质DNA-蛋白质结构或改变超螺旋的密度而改变模板的整体结构,从而使得RNA酶更容易与模板DNA相结合,起始基因的转录。 1)远距离效应; 2)无方向性; 3)顺式调节:只调节位于同一染色体上的基因; 4)无物种和基因的特异性; 5)具有组织特异性; 6)具有相位性:其作用和DNA构象有关; 7)有的增强子可对外部信号产生反应。 ★增强子的特点: 真核生物启动子的结构特点 1)启动子:确保转录精确而有效起始的DNA序列 2)真核生物启动子结构 核心启动子: 保证RNA Pol Ⅱ正常转录所必需的、最少的DNA序列。单独起作用时,只能确定转录起始位点并产生基础水平的转录。 TATA Box(TATA盒):-30~-25区,类似于原核的-10区。 功能:使转录精确起始。 上游启动子元件或称上游激活序列 CAAT Box( CAAT区):一致序列CCAAT,-70附近。 与原核的-35区对应。 GC Box( GC区):一致序列GCCACACCC或GGGCGGG,-70附近。 功能:控制转录起始的频率,基本不参与起始位点的确定。 3.4.6 真核生物启动子对转录的影响 原核和真核生物
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