拟南芥VPS30基因结构和功能分析-abc.PDFVIP

拟南芥VPS30基因结构和功能分析 The structure and function analysis of VPS30 in Arabidopsis thaliana 徐桐 洪煜 兰子君 原荣荣 主要内容 • 背景介绍 • VPS30基因的基本信息分析 • VPS30基因的功能探索 • 总结 • 致谢 拟南芥生活史 VPS30 基因的发现 The phenotype of +/bcl1 The expression pattern of VPS30 VPS30基本信息检索 SMART预测结构域 APG6是一个保守的结构域，在自噬过程中起作用 NCBI BLAST 寻找同源蛋白 Phylogenetic tree 盘基网柄菌 MEME 预测结构域 VPS30在酵母中的工作模型 互作蛋白预测 VPS30 VPS34 VPS15 亚细胞定位分析 Tmpred 预测跨膜结构域 VPS30 不含跨膜结构域 SWISS-MODEL 同源模建 C-terminal structure of Human beclin The model of VPS30 Fit together RMS：0.49 总结 方法 信息 对实验的指导 文献检索 VPS30在人和酵母中与其它 设计实验验证其在拟 蛋白形成复合体，参与自噬 南芥中是否参与自噬 过程 以及是否形成复合体 定位分析 定位在细胞质和细胞核中 确定亚细胞定位 互作蛋白预测 可能与VPS34 VPS15等蛋白 设计实验验证互作 互作 体外：酵母双杂等 体内：Co-IP 结构和功能域预 C端结构域对蛋白行使自噬 设计实验验证C端功能 测 功能重要 域 截短实验 点突实验 致谢 • 感谢罗老师这学期辛苦的付出 • 感谢助教为我们讲序列比对的算法 • 感谢小组成员兰子君、徐桐、洪煜