基于cpdnarps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系.pdfVIP

林业科学研究　２０１６，２９（３）：３７７ ３８２ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　文章编号：１００１１４９８（２０１６）０３０３７７０６ 基于ｃｐＤＮＡｒｐｓ１６序列分析兰考泡桐与 白花泡桐和毛泡桐的遗传关系 １，２ １ ３ １ １ ２ 莫文娟 ，李少锋 ，邱乾栋 ，孙长忠 ，汤志敏 ，乔　杰 ２ ２ 杜红岩 ，傅建敏 （１．中国林业科学研究院华北林业实验中心，北京　１０２３００；２．中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南 郑州　４５０００３； ３．北京林业大学生物科学与技术学院，北京　１０００８３） 摘要：【目的】通过测序法分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐在叶绿体ｒｐｓ１６序列上的遗传差异，旨在分析三者之间 在叶绿体基因上的变化特点和规律，探讨其种间的遗传关系。【方法】选取兰考泡桐、白花泡桐和毛泡桐各 １５个样 本，对其提取的ＤＮＡ用ＰＣＲ扩增获得特异片段，并将其纯化与测序。利用软件ＣｌｕｓｔａｌＸ２．０对所得序列进行排序； 运行ＭＥＧＡ４软件，进行多序列比对，分析其序列特征，并计算出Ｋ２Ｐ遗传距离。【结果】（１）对获得的ｒｐｓ１６序列进 行测定分析，得兰考泡桐序列长度分别为９３２ ９３３ｂｐ；白花泡桐序列长度为９３２ｂｐ；毛泡桐序列长度分别为９１６ ９１８ｂｐ。对所得ｒｐｓ１６序列进行排序后的长度为９３８ｂｐ，平均ＧＣ含量为３４．３１％。３个种所代表的个体之间共有１０ 个变异位点，占整个序列长度的１．０７％。其中有９个变异位点属于碱基插入或缺失类型，占变异位点总数的９０％， 占整个序列长度的０．９６％。有１个变异位点属于碱基替换类型，占整个变异位点总数的１０％，占整个序列长度的 ０．１１％。（２）整个ｒｐｓ１６片段的序列共有１０个变异位点，其中兰考泡桐与白花泡桐在总的变异位点上，具有一致的 碱基位点９个，占总变异的９０％。而兰考泡桐与毛泡桐相比，没有相同的碱基。【结论】根据三种泡桐的ｒｐｓ１６序列 的序列特征和变异位点的分析，表明在叶绿体遗传方面，兰考泡桐具有与白花泡桐更多相似的遗传物质，其亲缘关 系较近。综上所述，推测兰考泡桐与白花泡桐可能来自同一母系遗传。 关键词：兰考泡桐；白花泡桐；毛泡桐；ｒｐｓ１６ 中图分类号：Ｓ７９２４３ 文献标识码：Ａ ＧｅｎｅｔｉｃＲｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓａｍｏｎｇＰａｕｌｏｗｎｉａｅｌｏｎｇａｔａ，Ｐａｕｌｏｗｎｉａｆｏｒｔｕｎｅｉａｎｄ ＰａｕｌｏｗｎｉａｔｏｍｅｎｔｏｓａＢａｓｅｄｏｎｃｐＤＮＡｒｐｓ１６ＲｅｇｉｏｎＳｅｑｕｅｎｃｅｓ １，２ １ ３ １ １ ＭＯＷｅｎｊｕａｎ ，ＬＩＳｈａｏｆｅｎｇ，ＱＩＵＱｉａｎｄｏｎｇ，ＳＵＮＣｈａｎｇｚｈｏｎｇ，ＴＡＮＧＺｈｉｍｉｎ， ２ ２ ２ ＱＩＡＯＪｉｅ，ＤＵＨｏｎｇｙａｎ，ＦＵＪｉａｎｍｉｎ （１．ＦｏｒｅｓｔｒｙＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒｏｆＮｏｒｔｈＣｈｉｎａ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ，Ｂｅｉｊｉｎｇ　１０２３００，Ｃｈｉｎａ；２．ＮｏｎｔｉｍｂｅｒＦｏｒｅｓｔｒｙＲｅｓｅａｒｃｈ＆ ＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙ，Ｚｈｅｎｇｚｈｏｕ　４５０００３，Ｈｅ’ｎａｎ，Ｃｈｉｎａ；３．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， ＢｅｉｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｂｅｉｊｉｎｇ　１０００８３，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：［Ｏｂｊｅ