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dna复制 (dna replication)

Proofreading by DNA polymerase 两个拷贝的β亚基围绕DNA双螺旋形成一个环状的二聚体。一旦β亚基二聚体与DNA紧密结合,它的作用就像一个“滑动夹子”(sliding clamp)携带着核心聚合酶沿着DNA链自由滑动。 Beta forms a donut shaped ring around the DNA and helps to anchor the holoenzyme to the DNA during replication . By acting as a sliding clamp, beta helps the holoenzyme to replicate long stretches of DNA without falling off the strand (this is called processivity). 聚合酶的第3个组成部分是由5个亚基构成的一个所谓的γ复合体。γ复合体又称夹子装载因子(clamp loader),催化滑动夹打开,并将其结合在引物-模板上。介导β亚基与模板-引物双螺旋的结合。最后,两个拷贝的τ亚基使核心聚合酶形成二聚体。 3.在复制叉处先导链和后随链的合成同时进行 RNA引物合成以后,DNA的延伸过程便开始了。先导链被连续合成,而后随链是不连续合成的。在复制叉上,DNA解旋酶在后随链模板上沿着5→3运动。DNA聚合酶III全酶通过τ亚基和解旋酶相互作用,两个τ亚基分别与一个核心酶结合,其中一个核心酶复制前导链,另一个核心酶复制后随链。 DNA引物酶周期性地与DNA解旋酶结合,并在后随链模板上合成新的引物。当负责后随链合成的核心酶完成一个冈崎片段的合成后,即从滑动夹和DNA上脱落下来。随后,DNA聚合酶III的滑动夹装载因子在新形成的模板接头位置上,组装新的滑动夹。新组装的滑动夹与核心酶结合,起始下一个冈崎片段的合成。 新合成的冈崎片段与上一个冈崎片段被一切口分开。冈崎片段的RNA引物长约5个核苷酸,而它的DNA部分长约1 000~2 000 bp。DNA聚合酶I与切口结合,并利用其5→3外切酶活性切去下游冈崎片断的RNA部分,与此同时上游的冈崎片断,这一过程相当于切口平移。当RNA引物被切除后,由DNA连接酶催化磷酸二酯键的形成,从而把冈崎片断连接起来形成连续的不含RNA序列的后随链。 三、 Termination and segregation 细菌基因组的复制是从单一位点双向进行的。大肠杆菌的复制终止区域位于环状染色体上与复制起点相对的一侧。在这一区域存在若干个终止位点(Ter)。Ter序列按照特定的方向排列在染色体上(图),制造了一个“陷阱”。复制叉可以进入该区域,但不能出去,原因是Ter位点只在一个方向上发挥作用。当序列特异性DNA结合蛋白Tus与终止位点结合后,只阻断一个方向上的复制叉的前进,而对向另一个方向前进的 复制叉不起作用。例如,TerB阻断顺时针方向复制叉,TerA阻止逆时针方向复制叉。终止区这样的安排可确保两个从相反方向进入ter区的复制叉总能相遇,当一个复制叉遇到另一个复制叉时,DNA复制就完成了。 四、复制起始调控 大肠杆菌染色体DNA的 oriC含有11个拷贝的GATC序列。在DNA复制之前,染色体DNA上的每一GATC序列,包括oriC区域中的GATC,都被甲基化。 * 第三章:DNA复制 (DNA Replication) 第一节: DNA 的半保留复制 DNA在复制过程中首先两条亲本链之间的氢键断裂,双链分开,然后以每条亲本链(parental strand)为模板,按碱基互补配对原则(A:T,G:C),由DNA聚合酶催化合成新的互补子链(daughter strand)。复制结束后,每个子代DNA的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的,并且,新形成的两个DNA分子与原来的DNA分子的碱基序列完全相同。这种复制方式称为半保留复制(semiconservative replication)。 一、复制起点与复制子 Replicon: 作为一个单位进行复制的任何一段DNA序列。 它含有一个复制起点,有时还含有一个复制终点。 Origin :是复制子起始复制的一段DNA序列。 第二节:DNA的复制起点和复制方式 作为一个单位进行复制的任何一段DNA序列。 复制子的复制通常从一个固定的位点开始的,这种起始DNA复制的序列叫做复制起点。DNA复制时,双螺旋的两条链在复制起点处分开形成两条模板链。一旦复制开始,就会在DNA分子上形成两个复制叉(replication fork)。复制叉向着未复制的区域沿着DNA相向移动,因此复制是双向的。所有的原核生物的染色体,很多噬菌体和病毒的

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