comparison of bayesian clustering and edge detection methods for inferring boundaries in landscape genetics贝叶斯推断集群和边缘检测方法的比较边界景观遗传学.pdfVIP

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2017-09-12 发布于上海
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comparison of bayesian clustering and edge detection methods for inferring boundaries in landscape genetics贝叶斯推断集群和边缘检测方法的比较边界景观遗传学

Int. J. Mol. Sci. 2011, 12, 865-889; doi:10.3390/ijm OPEN ACCESS International Journal of Molecular Sciences ISSN 1422-0067 /journal/ijms Article Comparison of Bayesian Clustering and Edge Detection Methods for Inferring Boundaries in Landscape Genetics Toni Safner 1,2, Mark P. Miller 3,†, Brad H. McRae 4, Marie-Josée Fortin 5 and Stéphanie Manel 1,6,* 1 Laboratory of Alpine Ecology, Equipe Population Genomics and Biodiversity, UMR CNRS 5553, BP 53, University Joseph Fourier, 38041 Grenoble Cedex 9, France; E-Mail: tsafner@ 2 Department of Plant Breeding, Genetics and Biometrics, Faculty of Agriculture, University of Zagreb, Svetosimunska 25, 10000 Zagreb, Croatia 3 Department of Biology, Utah State University, 5305 Old Main Hill, Logan, UT 84321, USA; E-Mail: markperrymiller@ 4 The Nature Conservancy, 1917 1st Ave, Seattle, WA 98101, USA; E-Mail: mcrae@ 5 Department of Ecology Evolutionary Biology, University of Toronto, Ontario, M6R 2R8, Canada; E-Mail: fortinmj@ 6 Laboratory of Population Environment Development, UMR 151 UP/IRD, University Aix-Marseille I, 3 place Victor Hugo, 13331 Marseille Cedex 03, France † Present address: U.S. Geological Survey Forest and Rangeland Ecosystem Science Center, 3200 SW Jefferson Way, Corvallis, OR 97331, USA * Author to whom correspondence should be addressed; E-Mail: stephanie.manel@univ-provence.fr; Tel.: 0-413-550-747; Fax: + 0-491-083-036. Received: 15 December 2010; in revised form: 18 January 2011 / Accepted: 19 J