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湖南产牡丹遗传多样性的issr分析
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 7 期 2016 年 4 月 • 1193 • 湖南产牡丹遗传多样性的 ISSR 分析 1 1* 2 1 1 张桓 ,金晓玲 ,成仿云 ,卢惊鸿 ,吴 莎 1. 中南林业科技大学,湖南 长沙 410004 2. 北京林业大学,北京 100083 摘 要:目的 深入了解和掌握湖南产牡丹 Paeonia suffruticosa 的亲缘关系及遗传多样性。方法 利用 ISSR 分子标记生物 技术从 100 条 ISSR 引物中筛选出条带清晰、多态性好的引物 7 条,对源自湖南省内牡丹种质资源及部分实生后代共 47 份 样品 DNA 进行扩增实验。结果 共扩增获得 77 条带型完整清晰的谱带,其中多态性带为 67 条,多态位点比率为 87.01%, 表明湖南产牡丹种质资源多态性较高,具有较高的遗传多样性。经计算机软件计算结果分析,平均有效等位基因数为 1.395 4, 平均 Nei’s 基因多样性指数为 0.248 0,平均 Shannon’s 信息指数为 0.385 9;各品种间的Jaccard 相似系数介于 0.532 5~0.961 0, 平均为 0.751 5 。UPGMA 作图法将 47 份材料划分为 2 个类群 3 个亚类,很好地将不同来源的品种区分开来。结论 从分子水平 上揭示了湖南产牡丹品种间亲缘关系及较高的遗传多样性,为耐湿热牡丹的新品种选育工作提供了理论依据。 关键词:牡丹;亲缘关系;ISSR ;分子标记;遗传多样性 中图分类号:R282.12 文献标志码:A 文章编号:0253 - 2670(2016)07 - 1193 - 06 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.07.022 ISSR analysis on genetic diversity of Paeonia suffruticosa in Hunan province 1 1 2 1 1 ZHANG Min-huan , JIN Xiao-ling , CHENG Fang-yun , LU Jing-hong , WU Sha 1. Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, China 2. Beijing Forestry University, Beijing 100083, China Abstract: Objective In order to understand the genetic relationship and genetic diversity of peony (Paeonia suffruticosa) in Hunan province, the DNA fingerprints of 47 peony germplasm materials of Hunan province were studied. Methods Seven primers selected from 100 ISSR primers could obtain high polymorphism and reproducibility bands using ISSR markers. Results Total 77 DNA bands were amplified including 67 polymarphic bands, counting for 87.01%. Genetic similarity analysis showed that Hunan peony germplasm resourses with high genetic diversity. Through the computer software analysis, peony variety tested the average effective number of alleles was 1.395 4,
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