鱼消化道细菌群落结构及多样性初步研究preliminary-南方水产科学.pdfVIP

第 9 卷第 4 期 南 方 水 产 科 学 Vol. 9, No. 4 2 0 1 3 年 8 月 South China Fisheries Science Aug. , 2013 doi : 10. 3969/j. issn. 2095 - 0780. 2013. 04. 002 鱼消化道细菌群落结构及多样性初步研究 陶 诗, 王健鑫, 刘雪珠, 何芳芳, 俞凯成 ( 浙江海洋学院, 海洋生物资源与分子工程实验室, 浙江 舟山 316000) 摘要: 采用常规分离纯化与构建 16S rDNA克隆文库相结合的方法对 鱼( Miichthys miiuy) 消化道细菌多样性进行 了初步研究。结果表明, 鱼消化道各部位可培养细菌的菌落数量从大到小依次为前肠 幽门胃 中肠 后肠 前胃 后胃 口咽腔, 其中肠道部位菌落数量最多。分离细菌菌株主要为杆状细菌和革兰氏阴性菌, 对其中 的 50 株典型菌株进行分子鉴定, 发现它们主 要属于变形菌门的 γ-变形菌纲 ( 占 52. 7% ) 和 β-变 形菌纲 ( 占 36. 8% ) , 以及厚壁菌门的芽孢杆菌纲( 占 10. 5% ) ; 不可培养细菌 16S rDNA 文库克隆子主要属于 γ-变形菌纲、 α-变形菌纲和脱铁杆菌纲, 部分序列与已报道的物种相似性较低, 说明消化道中可能存在新的有待开发的肠道 菌株。 关键词: 鱼; 消化道; 细菌多样性 中图分类号: S 917. 1 文献标志码: A 文章编号: 2095 - 0780 - ( 2013) 04 - 0008 - 08 Preliminary research on bacterial community structure and diversity in digestive tract of Miichthys miiuy TAO Shi, WANG Jianxin, LIU Xuezhu, HE Fangfang, YU Kaicheng ( Lab. of Marine Living Resources and Molecular Engineering, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316000, China) Abstract: In this study, traditional culture-based techniques and the 16S rDNA sequencing method were used to investigate the mi- crobial community of the intestinal mucosal layer in the intestine of Miichthys miiuy. We find that the culturable bacteria in each part of M. miiuy digestive tract, sorted from most to least in number, are forefut, pylorus, midgut, hindgut, proventriculus, masticatory stomach and oropharyngea