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两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较-上海海洋大学学报
第 卷第 期 上 海 水 产 大 学 学 报 ， 15 4 Vol . 15 No .4 2006 年 月 ， 10 J0URNAL 0F SHANGHAI FISHERIES UNIVERSITY 0Ct . 2006 !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 文章编号： （ ） 1004 - 7271 2006 04 - 0403 - 06 两种鲷属鱼类线粒体 !# 基因片段 序列的比较 张凤英，马凌波，施兆鸿，夏连军，马春艳 （中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室，上海 200090 ） 摘 要：利用通用引物成功扩增了黄鳍鲷和黑鲷的线粒体细胞色素氧化酶 亚基（ ）基因序列。通过序列 I CO# 测定，得到 的基因片段，碱基 、、、平均含量分别为 、 、 和 ，序列中的 581 bp A T G C 25 . 8% 32 .6 % 18 .0 % 23 .6 % A + T 含量明显高于G + C 含量，与其他鱼类的 CO# 基因片段研究结果相一致。通过序列分析发现黄鳍鲷和黑鲷 两序列共存在 处碱基变异，其中在第 之间检测到 个变异位点，是变异频率较高的区段，可以 14 19 ~ 139 bp 13 考虑作为鲷属或者种群鉴别的分子标记。与黄鲷、真鲷、三长棘真鲷等鱼类比较，无插入和缺失位点，转换明 显高于颠换。序列差异比较结果显示，真鲷与黄鳍鲷的序列差异在这5 种鱼类中最大，达到了18 .2 % ，黄鳍鲷 和黑鲷的差异最小（ ）。两个序列已提交到 数据库中，序列登录号为： 和 。 2 .4 % GenBank DQ185608 DQ185609 关键词：鲷属；线粒体 ；细胞色素氧化酶 亚基基因；序列分析 DNA I 中图分类号： 文献标识码： S 917 A Studies on mitochondrial cytochrome o1idase subunit I fragments of two genera of $% arus fish ， ， ， ， ZHANG Feng-y
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