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产凝集素乳杆菌筛选及PCR-16SrDNA鉴定
产凝集素乳杆菌筛选及PCR-16SrDNA鉴定摘要:目的从泡菜汁中分离产凝集素乳杆菌并鉴定。方法通过凝集实验筛选产凝集素的乳杆菌,用聚合酶链式反应(PCR)扩增16S rDNA可变区基因鉴定产凝集素乳杆菌。结果此菌株呈革兰阳性,短杆状,产乳酸。通过同源性比较,此菌株与Lactobacillus plantarum strain p215的同源性为99 %。结论分离得到了产凝集素的菌株,鉴定表明此菌株为植物乳杆菌。
关键词:泡菜;乳杆菌;分离;鉴定;凝集活性;DNA;核糖体;序列分析
中图分类号:Q513+.2文献标识码:A文章编号:1672-979X(2008)09-0009-03
Screening of Lectin-producing Lactobacillus and Identification of its 16S rDNA Gene
XU Jin1, ZHAO Sheng-lan2, CHEN Chao-yin1*
(1. Institute of Bioresource RD of Kunming University of Science and Technology-Tsinghua University, Kunming 650224, China; 2. Department of Applied Pharmacy, Yunnan Institute of Traditional Chinese Medicine, Kunming 650220, China)
Abstract:Objective To isolate and identify lectin-producing lactobacillus from sauerkraut juice. Methods The lectin-producing lactobacillus was isolated by hemagglutination assay and identified by polymerase chain reaction (PCR) amplification of variable regions of the 16S rDNA gene. Results This strain was gram-positive, short bacilliform and lactic acid-producing. The homology to Lactobacillus plantarum strain p215 was 99 %. Conclusion The lectin-producing lactobacillus is obtained and identified as Lactobacillus plantarum.
Key words:sauerkraut; lactobacillus; isolation; identification; agglutinating activity; DNA; ribosome; sequence analysis
凝集素是一类由动植物细胞分泌的糖蛋白,在细胞识别及黏着反应中起重要作用。近年,凝集素的研究取得了重大进展,其家族成员不断增加,同时发现了凝集素的更多功能,如促有丝分裂,细胞识别,病毒的毒力决定子,凝集恶性细胞、精子、骨髓细胞等。由于凝集素具有高度的糖结合专一性,已成为研究生物学和临床学非常有用的工具,用于分离纯化和确定糖复合体、细胞分裂、鉴定微生物、肿瘤诊断、治疗及预防骨髓移植等[1,2]。研究还表明,某些凝集素具有抗HIV活性[3,4]。鉴于目前还未见植物乳杆菌产凝集素抗HIV的报道,因此我们以泡菜为研究对象,分离鉴定乳杆菌及筛选出产凝集素的乳杆菌,对深入研究凝集素的抗HIV功能具有重要意义。
目前,微生物可以通过基因的相似性分类,从而反映其在进化过程中的地位。在生物进化的漫长过程中,rRNA/rDNA分子保持相对恒定的生物学功能和保守的碱基排列顺序,在结构上可分为保守区(conserved domain)和可变区(variable domain)。l6S rRNA/rDNA序列分析方法就是利用16S rRNA/rDNA保守区序列特别保守的特点,设计引物扩增16S rRNA/rDNA片段,利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定[5]。
1材料与方法
1.1材料
泡菜样品(市售);MRS培养基(参照文献[6]配制)。
1.2乳杆菌的分离鉴定
1.2.1泡菜汁样品中乳杆菌的分离过滤市售泡菜汁样品,将滤液稀释为100,10-1,10-2,10-3,10-4,10-5,10
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