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水稻苯达松敏感致死基因(ben)的电子杂交定位和基因预测.pdf
第 30 卷 第 11 期 作 物 学 报 Vol. 30 , No. 11
2004 年 11 月 1152～1158 页 ACTA AGRONOMICA SINICA pp. 1152 - 1158 Nov. , 2004
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水稻苯达松敏感致死基因 ben 的电子杂交定位和基因预测
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杨剑波 向太和 李 莉 王永杰 黄大年
( 1 安徽省农业科学院水稻研究所 ,安徽合肥 230031 ;2 中国水稻研究所,浙江杭州 310006)
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摘 要 来自水稻突变体的苯达松敏感致死基因 ben 能够作为一种除草剂筛选标志用于杂交水稻种子的安全生产 。
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本研究利用我们已得到的与 Benben 基因紧密连锁的两个 RAPD 标记 OPG18972 ,OPG18943 以及与该标记高度同源的
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跨叠克隆 Contig10968 来自中国水稻基因组框架序列 ,全长 8 273 bp 的序列信息 ,沿标记的两端设计新的 PCR 引物 , 以携
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带苯达松抗性基因 Ben 和苯达松敏感基因 ben 的水稻近等基因系为模板 ,通过对扩增产物的序列拼接和比对 ,成功地
将 OPG18972 和 OPG18943 标记从 972 bp 和 943 bp 步移延伸到 8 138 bp 和 8 103 bp (提交到 GenBank 的登记号分别为
AY181204 和 AY181203) 。并利用电子杂交将延伸后的序列定位于水稻第2 染色体上 1505 cM 处 ,在对标记两端及其附
近的序列进行生物信息学分析后 ,我们初步预测 Ben 基因可能是编码某种受体蛋白的基因或催化 6OH苯达松与葡萄糖
缀合的淀粉合成酶类似基因。
关键词 水稻 ;苯达松敏感致死基因 ;定位 ;预测 ; 电子杂交
中图分类号:S511
Location of Bentazon Sensitive Lethality Gene ( ben) on Rice Chromosome and
Its Gene Forecast in silico
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YANGJianBo , XIANG TaiHe , LI Li , WANG YongJie , HUANG DaNian
(1 Rice Research Institution ,Anhui Academy of Agricultural Sciences , Hefei 230031 ,Anhui ;2 China National Rice Institution , Hangzho
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