桉树焦枯病菌ABC转运蛋白的鉴定与分析.PDFVIP

林业科学研究　２０１７，３０（４）：６８５ ６９２ ＦｏｒｅｓｔＲｅｓｅａｒｃｈ 　　ＤＯＩ：１０．１３２７５／ｊ．ｃｎｋｉ．ｌｙｋｘｙｊ．２０１７．０４．０２２ 桉树焦枯病菌ＡＢＣ转运蛋白的鉴定与分析 １ ２ ２ １ １ １ 刘宏毅 ，陈全助 ，叶小真 ，陈慧洁 ，李慧敏 ，冯丽贞 （１．福建农林大学林学院，福建 福州　３５０００２；２．福建农林大学金山学院　福建 福州３５０００２） 摘要：［目的］利用生物信息学方法探讨ＡＢＣ转运蛋白在焦枯病菌对桉树侵染过程中的解毒作用，为揭示桉树焦枯 病致病机制奠定基础。［方法］本文利用ＢＬＡＳＴ、ＨＭＭＥＲ、Ｐｆａｍ数据库、ＴＣＤＢ数据库在全基因组内对桉树焦枯病菌 的ＡＢＣ转运蛋白进行鉴定和分类，并通过ＰｒｏｔＣａｍｐ和ＩＢＳ分别进行亚细胞定位和结构域图绘制，依据同源性对其 功能进行推测分析。［结果］表明：桉树焦枯病菌共有７０个ＡＢＣ转运蛋白，它们分属于８个亚族。７１％的转运蛋白 位于细胞膜，１０％位于液泡，其余部分位于线粒体、过氧化物酶体、内质网等内膜系统上。桉树焦枯病菌ＡＢＣ转运 蛋白包含全分子、四分之三分子、半分子及四分之一分子。根据同源性推测桉树焦枯病菌ＡＢＣ转运蛋白与ＭＤＲ、 ＰＤＲ、ＨＭＴ、ＭＰＥ、ＳＴＥ、ＰＦＡＴ等几种转运蛋白具有较高相似性，同时还与核糖体合成、翻译、过氧化物酶体合成的 ＡＢＣ转运蛋白具有较高相似性。［结论］桉树焦枯病菌ＡＢＣ转运蛋白除作为外排泵转运外源化学物质、疏水性化学 分子等物质。还参与细胞代谢、翻译、核糖体的合成、ｍＲＮＡ的输出、 氧化，并通过为辅酶Ｑ的辅助因子增强呼吸 β 代谢等多项生命活动为焦枯病菌的侵染提供能量。 关键词：桉树；焦枯病菌；ＡＢＣ转运蛋白；结构域；亚细胞定位 中图分类号：Ｓ７６３．７ 文献标识码：Ａ　　　文章编号：１００１１４９８（２０１７）０４０６８５－０８ ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＡＢＣＴｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｉｎＣａｌｏｎｅｃｔｒｉａｐｓｅｕｄｏｒｅｔｅａｕｄｉｉ ＬＩＵＨｏｎｇｙｉ，ＣＨＥＮＱｕａｎｚｈｕ，ＹＥＸｉａｏｚｈｅｎ，ＣＨＥＮＨｕｉｊｉｅ，ＬＩＨｕｉｍｉｎ，ＦＥＮＧＬｉｚｈｅｎ （１．ＦｏｒｅｓｔｒｙＣｏｌｌｅｇｅ，ＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｕｚｈｏｕ　３５０００２，Ｆｕｊｉａｎ，Ｃｈｉｎａ； ２．ＪｉｎｓｈａｎＣｏｌｌｅｇｅ，ＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｕｚｈｏｕ　３５０００２，Ｆｕｊｉａｎ，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：［Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ］ＵｓｉｎｇｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｍｅｔｈｏｄｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｄｅｔｏｘｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆＡＢＣｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｓｉｎＣａｌｏｎｅｃ ｔｒｉａｄｕｒｉｎｇｔｈｅｐｒｏｃｅｓｓｉｎｆｅｃｔｉｎｇＥｕｃａｌｙｐｔｕｓ，ａｎｄｔｏｐｒｏｖｉｄｅｒｅｆｅｒｅｎｃｅｓｆｏｒｒｅｖｅａｌｉｎｇｔｈｅｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆＣａ ｌｏｎｅｃｔｒｉａ．［Ｍｅｔｈｏｄ］ＵｓｉｎｇＢＬＡＳＴ，ＨＭＭＥＲ，Ｐｆａｍｄａｔａｂａｓｅ，ＴＣＤＢｄａｔａｂａｓｅｔｏｉｎｄｅｎｔｉｆｙａｎｄｃｌａｓｓｉｆｙｔｈｅＡＢＣ ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｏｆＣａｌｏｎｅｃｔｒｉａｗｉｔｈｉｎｔｈｅｗｈｏｌｅｇｅｎｏｍｅ，ａｎｄｔｏｐｒｅｄｉｃｔｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎａｎｄｔｈｅｄｏｍａｉｎｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｓｃｈｅｍｅｗｉｔｈＰｒｏｔＣａｍｐａｎｄＩＢＳ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．［Ｒｅｓｕｌｔ］Ｃａｌｏｎｅｃｔｒｉａｈａｓａｔｏｔａｌｏｆ７０ＡＢＣｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｓ，ｗｈｉｃｈｂｅ ｌｏｎｇｔｏ８ｓｕｂｆａｍｉｌｉｅｓ．７１％ ｏｆｔｈｅｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｓａｒｅｌｏｃａｔｅｄｉｎｔｈｅｃｅｌｌｍｅｍｂｒａｎｅ，１０％ｉｎｔｈｅｖａｃｕｏ