美国白蜡抗寒基因FaSAD的克隆及进化分析_陈罡.pdfVIP

2015年 辽 宁 林 业 科 技 2015 第6期 Journal of Liaoning Forestry Science ＆Technology №6 美国白蜡抗寒基因FaSAD 的克隆及进化分析 1 1 1 1 1 2* 陈 罡 ，叶景丰 ，马冬菁 ，魏忠平 ，刘红民 ，白丽萍 （1.辽宁省林业科学研究院，辽宁 沈阳 110032；2.沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室，辽宁 沈阳 110161） 摘 要：利用RT-PCR 和RACE 技术从美国白蜡总RNA 中分离出硬脂酰-ACP 脱饱和酶（SAD）基因 的全长cDNA。该序列所推导的氨基酸序列与已知SAD 蛋白序列具有高度的相似性，同时又存在 单个氨基酸残基或基序的替换、插入和缺失。半定量PT-PCR 表明，SAD 基因在白蜡茎中表达量最 高，在叶片中最低；FaSAD 蛋白质三级结构预测表明，其是个结构紧密的球形蛋白；进化分析表明， 来自同一家族的基因基本上聚到了1 个群，但是来自木本植物的所有基因被分成2 个大群，没有都 被聚到1 个独立的群中，FaSAD 基因与猫爪藤的SAD 基因相似性最高。 关键词：美国白蜡；低温；硬脂酰-ACP 去饱和酶（SAD）；进化分析 中图分类号：Q781 ；S792.41 文献标识码：A 文章编号：1001-1714（2015 ）06-0001-06 CloningCloning andand evolutionevolution analysisanalysis ofof thethe cold-relatedcold-related genegene inin FraxinusFraxinus americanaamericana 1 1 1 1 1 2* CHEN Gang ，YE Jingfeng ，MA Dongjing ，WEI Zhongping ，LIU Hongmin ，BAI Liping （1. Liaoning Academy of Forestry Sciences ，Shenyang 110032，China ；2. Key Laboratory of Agricultural Biotechnology of Liaoning Province ，College of Biosciences and Biotechnology ，ShenyangAgricultural University ，Shenyang 110161，China ） Abstract：Using RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends ，a new full-length cDNAs of SAD （FaSAD ）was obtained from Fraxinus americana.Sequence analysis showed that the deduced amino acid sequence of FaSAD has high similarity to others reported SAD proteins.They are different each other by some substitutions ，insertions and/or deletions involving single amino acid residues or motifs.The result of semi-quantitative RT-PCR analysis showed that the expression of SAD gene had the h