中国汉族人群17个心血管疾病易感基因位点基因型和基因频率分析_5639728百替生物.pdfVIP

中国汉族人群 17 个心血管疾病易感基因位点基因型和基因 频率分析 【摘要】 目的: 调查中国汉族人群中 17 个心血管疾病易感基因位点的基因型和基因频 率. 方法: 运用基因芯片技术同时检测 138 例来自中国大部分省市的汉族人的 13 个心血 管易感基因的 17 个 SNPs. 结果: 国内未曾见报道的 4 个基因位点基因型频率分别为： ET?2985 AA∶AG∶GG 为 2.2% (3)∶22.2% (30)∶75.6% (102)；NPRC(-55) AA∶AC∶CC 为 8.1% (11)∶23.0% (31)∶68.9% (93)；KCNQ1140 则只发现了 SS 基因型；CYP46rs754203 CC∶CT∶TT 为 55.0％(66)∶20.0%(24)∶25.0%(30). ApoBMsp1 +∶-为 92％（232） ∶8％ （20），而 Hapmap 公布的则为 100％（90） ∶0％（0），两者比较，差异有统计学意义 （χ2=7.587，P=0.000）. MTHFR677 C∶T 为 70％（168） ∶30％（72），与Hapmap 中中 国北京汉族人（CHB）公布的结果 48.9％（44） ∶51.1％（46），以及 ALFRED 中公布的 中国香港汉族 （SA0008510）77.8％（322）∶22.2％（92）比较，差异具有统计学意义（χ2 和 P 分别为 12.70，0.000； 4.89， 0.027）. 其他位点的调查结果与 Hapmap 计划中 CHB （ANP2238, ApoBXbaⅠ, NOS3298, ApoBEcorⅠ和 ApoE112）和ALFRED 网站的 SA0008510 的基因频率（AGT235, ACEAlu, ApoCⅢ3175, ApoCⅢ3206, ApoE158 和 SerpinA3rs4934） 有较好的吻合. 结论：SNPs 频率分布具有种族和地区差异，中国汉族人群中 ANP2238 C, ApoBEcorⅠ （-）和KCNQ1140 G, 是少见的等位基因（5%)，可能不是心血管疾病的主要 原因. 用基因芯片检测多个心血管疾病易感基因 SNPs 结果可靠. 0 引言 目前的研究普遍认为原发性高血压、动脉粥样硬化、冠状动脉心脏病及脑血管意外等 心血管疾病是多因素疾病，是由位于多个易感基因中的多个 SNPs 微效作用累加，与环境 因素相互作用而发病. 不同的 SNPs 的不同组合，使不同人群具有不同的心血管疾病易患 性、导致相应疾病的临床表现各异，治疗效果不同. 因此，对心血管疾病候选基因 SNPs 的研究是目前心血管疾病研究的热点，研究结果可用于对相关疾病的辅助诊断、治疗方法 的选择和预后的估计，更重要的是可以进行易患风险的预测，从而利于疾病的预防. 但是 SNPs 在不同人群的分布的基因频率有很大的差异，具有种族和地区特色，因此针对不同 人群 SNPs 研究应首先了解 SNPs 的频率分布情况，挑选该人群中具有一定基因频率的SNPs 进行. 本研究我们利用基因芯片技术调查分析中国汉族人群中 13 个心脑血管疾病相关基 因［1-6］的 17 个 SNPs 的基因型和基因频率，以了解其在中国汉族人群中的分布特点. 1 对象和方法 1.1 对象 均来自 2005?04/2006?09 在广东省深圳市人民医院门诊常规体检者，经有关检查除外 原发性高血压、冠心病等心血管疾病 138(男 90，女 48)例，平均年龄 50.3±10.5 岁. 调 查对象均为彼此之间无血缘关系汉族，原籍分布中国大部分省份. 1.2 方法 service@100 1.2.1 标本采集和检测 取外周血 3 mL, 终浓度为 2 g/L 的 EDTA 抗凝，上下颠倒数次混匀，存放于-20℃备 用. DNA 抽提后，用针对每个 SNPs 的引物分别进行 PCR 扩增，混合的 PCR 产物与基因芯 片杂交、显色，最后检测荧光. DNA 抽提、PCR 扩增、杂交、显色及检测等步骤都严格按 照上海百傲公司的 Baio 基因型检测芯片试剂盒使用说明书进行，芯片用 BaiO 基因芯片识 读仪检测，检测图像经 Array Doctor 软件分析. 1.2.2 质量控制对基因芯片检测的准确性，用 DNA 测序的方法进行了验证，准确率 97.8％. 在每次检测中都设置阴性、阳性对照品. 样本检测