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数量遗传基本:第三章有限大小的群体和近交
第一、二章内容要点
基因型频率,基因频率
自交和回交的遗传效应
随机交配(Random mating )
Hardy-Weinberg平衡及其检验
隐性有害基因携带者的比例
影响群体结构的原因
系统过程(systematic process )
分散过程(dispersive process )
第一、二章内容要点
连锁(Linkage )
A (A1 ,A2 )—B (B1,B2 ),重组率r
相引连锁(Linkage in coupling )
• A1B1 ,A2B2 ,(1-r)/2
互斥连锁(Linkage in repulsion )
• A1B2 ,A2B1 ,r/2
连锁不平衡(Linkage disequilibrium )
第一、二章内容要点
配子别不平衡(Gametic phase disequilibrium )
等位基因和频率 A ,p A ,q B ,p B ,q
1 A 2 A 1 B 2 B
配子基因型 A B A B A B A B
1 1 1 2 2 1 2 2
平衡频率 p A p B p A qB qA p B qA qB
观测频率 u s t v
连锁不平衡度 +D -D -D +D
不平衡度(Degree of disequilibrium )
D uv −st
注意1:连锁并非一定存在不平衡
随机交配可打破连锁不平衡 D D (1−r)t
t 0
0.25
r=0.01
0.20
度 r=0.05
衡 0.15
平
不 r=0.1
锁 0.10
连
r=0.2
0.05
0.00 r=0.3
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
随机交配次数
果蝇,位点A和B,在同一条
染色体,相差17.8kb
Haplotype
观测值 观测频率 期望频率 期望值
A B
+ + 4 0.085 0.06
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