贝叶斯推论与其在百合目分子系统学中的应用.pdf

云 南 植 物 研 究 2007 , 29 (2 ) : 161～166 Acta Botanica Yunnanica 贝叶斯推论及其在百合 目分子系统学中的应用  1, 2 1 1 1 2 陈士超 , 杨 红 , 李 珊 , 祝 建 , 傅承新 ( 1 同济大 学生命 科学 与技术 学院 , 上海 2000 92 ; 2 浙 江大学 生命 科学学 院 系 统进化 植物 学与生 物多样 性实 验室 , 浙江 杭 州 3 10058 ) 摘要: 贝叶斯推论作为进化生物学的必威体育精装版进展 , 在适用复杂模型、大型数据集、计算速度和结果容易解释 等方面 明显优于其它算法 。本文简要介绍了贝叶斯推论原理及 其在分子进化和系统发育研究中的重要 性, 并使用该方法对百合 目主要类群的系统发育关 系进行 了重建 。结果显示 , 百合 目 rbcL 基因最适合 的 DNA 进化模型为 GTR + I + G, 贝叶斯法与距离法和 最大简 约法构建的系 统发育树拓扑结构相似 , 没有显著差 异 , 但是分辨率和支持率明显 比后者高。贝叶斯分析结果显示 , 百合 目内划分的 7 个科 , 除 Smilacaceae 科 外 , 其余各科均为高后验概率 ( PP = 1.0) 支持的单系类群 ; 文 中作者还对各科间的系统关系进行了探讨 。 关键词 : 百合 目; 贝叶斯推论 ; rbcL ; 系统发育 中图分类号 : Q332 , Q 949 文献标识码 : A 文章编号: 0253 - 2700 ( 2007) 02 - 161 - 06 Bayesian Inference and Its Application in the Molecular Phylogeny of Liliales 1 , 2 1 1 1 2 * * CHEN Shi-Chao , YANG Hong , LI Shan , ZHU Jian , FU Cheng-Xin ( 1 College of Lif e Science and Technology , Tongj i University , Shanghai 200092 , China ; 2 Colleg e of Lif e Science , Z hej iang University , Hangzhou 310 029 , China )