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文章编号:1674 - 5566 (20 12)05 - 0662 - 09
缺刻缘绿藻转录组测序及脂质代谢相关基因注释
,
陈思弘 周志刚
( , 201306)
上海海洋大学水产与生命学院 上海
: (ArA) :
摘 要 为了能深入地了解缺刻缘绿藻花生四烯酸 和脂质的代 研究亮点 首次利用次世代
, Roche 454 GS FLX
谢过程 利用 测序仪对该藻转录组进行高通量的焦 大规模平行测序技术对缺刻
。 (read)382 468 , 97 . 14 % , ,
磷酸测序 得到高质量读序 条 占原始读序的 缘绿藻的转录组进行测序 得
322 bp , 123 Mb 。 CAP3 ,
平均每条读序长 总大小达 经 软件拼接得到 到大量的基因信息 并利用生
22 7 14 条重叠群、25 621 条singleton 。将这些序列与公共数据库进行同 物信息学手段构建了缺刻缘
源性有哪些信誉好的足球投注网站、 、 。 ,
比较 基因功能注释和分类 基于转录组中所注释的基因构 绿藻脂质代谢途径 为缺刻缘
: , 、
建缺刻缘绿藻脂质代谢途径 脂肪酸是在叶绿体内从头合成 然后游离 绿藻脂质代谢调控 基因改造
, , 。
脂肪酸进入胞质 由内质网进行三酰甘油的合成 最后可能在油体蛋白 等研究提供翔实的数据
。ArA : ;
作用下形成油滴并储在于细胞中 自油酸是开始经过多个去饱和 关键词 缺刻缘绿藻 转录
。 -ACP ; ;
酶及延长酶的作用而产生的 油酸是由硬脂酰 去饱和酶作用而形 组 焦磷酸测序 脂质代谢途
, 。
成的 而棕榈油酸是在叶绿体的糖脂上被去饱和而产生的 三酰甘油最 径
, - A :S 917
终被分解成自由脂肪酸和丙酮酸 而长链脂肪酸是以酰基 辅酶 的形 中图分类号
式逐级降解的。 文献标志码:A
(arachidonic acid ,ArA ) 。 ,
花生四烯酸 是一种 酸及油脂的合成代谢途径了解甚少 因此 为了
-6 , ArA
ω 系长链多不饱和脂肪酸 是哺乳动物脑细胞 阐明和完善缺刻缘绿藻 等脂质合成和分解
[
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