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玉米WRKY基因聚类分析
38 3 Vol. 38 No. 3
第 卷 第 期 曲 阜 师 范 大 学 学 报
20 12 7 Journal of Qufu Normal University July 20 12
年 月
玉米WRKY 基因聚类分析
李修善
(曲阜师范大学生命科学学院,273165 ,山东省曲阜市)
摘要: http :/ / www. maizesequence. org ZmB73_4a. 53_filtered_cds. fasta , WRKY
从 网站下载的 文件 按照
, perl , 61 WRKY .
基因家族的保守结构域 用 程序进行分析筛选 获得了 个玉米 基因 对其所翻译的氨基酸序列
经比对和系统发生分析后, 61 , : 61 WRKY
将该 个基因进行了分类 结果表明 该 个玉米 转录因子中共有 Ⅰ类
13 、 32 、 16 . WRKY . WRKY
个 Ⅱ类 个 Ⅲ类 个 聚类分析结果与该三类 转录因子的进化关系相一致 对玉米 基
WRKY , .
因的分类将有助于深入研究 在玉米中的生理功能 从而应用于玉米生产
关键词: ;WRKY ; ;
玉米 聚类分析
: : :
中图分类号 S565 . 6 ;Q785 文献标识码 A 文章编号 1001-5337 (2012)03-0093-05
WRKY 转录因子是近年来在植物中发现的一 从而调节启动子区域含有W-box 元件的调节基因
, N- . ,WRKY
类重要转录因子 由于其 末端含有高度保守的 或功能基因的表达 已有证据表明 基因家
WRKYGQK . ,
氨基酸序列而得名 此外 在该结构域的 族与生物和非生物逆境激发的应激反应关系密
C- :C -H C -HC [1]. WRKY [13]. , 、 、
端有一个锌指结构 2 2 或者 2 切 此外 在果实成熟 种子表皮毛发育 蔗糖信
Ishiguo [2] 1994 号传导及赤霉素信号传导等过程中均发现了
转录因子首先由 等 于 年在甘薯中发
[3] WRKY [14]. WRKY
. (Avena f atua) 、 基因的表达 进行玉米 转录因子
现 随后在野燕麦 皱叶欧
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