利用DNA条形码对10种苍耳属杂草的鉴定.pdfVIP

杂草学报　２０１６年第３４卷第３期 — １１— 袁俊杰，马新华，龙　阳，等．利用ＤＮＡ条形码对１０种苍耳属杂草的鉴定［Ｊ］．杂草学报，２０１６，３４（３）：１１－１６． 利用 ＤＮＡ条形码对 １０种苍耳属杂草的鉴定 １ １ １ ２ １ １ １ 袁俊杰 ，马新华 ，龙　阳 ，魏　霜 ，张　娜 ，陈　文 ，杨卓瑜 （１．湛江出入境检验检疫局，广东湛江５２４０２２；２．汕头出入境检验检疫局，广东汕头５１５０００） 　　摘要：使用ＩＴＳ、ＩＴＳ２、ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ、ｒｂｃＬ和ｍａｔＫ等序列对截获的１０种苍耳属（Ｘａｎｔｈｉｕｍ）杂草进行扩增测 序，比较各序列的扩增和测序效率，采用最近距离法和相似性有哪些信誉好的足球投注网站算法评价不同序列的鉴定效率。采用最佳 鉴定序列计算种间Ｋ２Ｐ距离并构建系统进化树。结果表明，ＩＴＳ、ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ２个序列的扩增效率和鉴定效率 最高；ＩＴＳ序列的种间变异最大，其次是ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ序列，ｍａｔＫ序列的种间变异最小；ＩＴＳ序列的Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ Ｊｏｉｎｉｎｇ（ＮＪ）树可明显地将不同苍耳属杂草种分开；ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ序列可明显地将国内苍耳种和检疫性苍耳种分 开。说明利用ＤＮＡ条形码能够准确地鉴别苍耳属杂草，ＩＴＳ和ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ序列是鉴别苍耳属杂草较理想的条 形码组合。该研究结果为苍耳属杂草的分子鉴别提供了科学依据与新的思路。 　　关键词：ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ；ＩＴＳ；ＤＮＡ条形码；苍耳属；杂草鉴定 　　中图分类号：Ｓ４５１　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００３－９３５Ｘ（２０１６）０３－００１１－０６ ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆＴｅｎＸａｎｔｈｉｕｍｗｅｅｄｓＵｓｉｎｇＤＮＡＢａｒｃｏｄｉｎｇＳｅｑｕｅｎｃｅｓ １ １ １ ２ １ １ １ ＹＵＡＮＪｕｎｊｉｅ，ＭＡＸｉｎｈｕａ，ＬＯＮＧＹａｎｇ，ＷＥＩＳｈｕａｎｇ，ＺＨＡＮＧＮａ，ＣＨＥＮＷｅｎ，ＹＡＮＧＺｈｕｏｙｕ （１．ＺｈａｎｊｉａｎｇＥｎｔｒｙ－ｅｘｉｔＩｎｓｐｅｃｔｉｏｎａｎｄＱｕａｒａｎｔｉｎｅＢｕｒｅａｕ，Ｚｈａｎｊｉａｎｇ５２４０２２，Ｃｈｉｎａ； ２．ＳｈａｎｔｏｕＥｎｔｒｙ－ｅｘｉｔＩｎｓｐｅｃｔｉｏｎａｎｄＱｕａｒａｎｔｉｎｅＢｕｒｅａｕ，Ｓｈａｎｔｏｕ５１５０００，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＤＮＡｆｒｏｍｔｅｎｗｅｅｄｓｐｅｃｉｅｓｏｆｔｈｅｇｅｎｕｓＸａｎｔｈｉｕｍｗａｓａｍｐｌｉｆｉｅｄａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｅｄｕｓｉｎｇｆｉｖｅｃａｎｄｉｄａｔｅｓｅ ｑｕｅｎｃｅｓ（ＩＴＳ＼ＩＴＳ２＼ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ＼ｒｂｃＬａｎｄｍａｔＫ）．ＴｈｅＰＣＲａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｅｆｆｉｃｉｅｎｃｉｅｓｗｅｒｅｃｏｍｐａｒｅｄ ａｎｄｔｈｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙｗａｓａｓｓｅｓｓｅｄｕｓｉｎｇＢＬＡＳＴ１ａｎｄＤｉｓｔａｎｃｅｍｅｔｈｏｄｓ．Ｔｈｅｂｅｓｔｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｓｅｑｕｅｎｃｅ ｗａｓａｎａｌｙｚｅｄａｎｄｔｈｅＮＪｔｒｅｅｗａｓｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ．ＴｈｅａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｅｆｆｉｃｉｅｎｃｉｅｓｏｆＩＴＳ，ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨｗｅｒｅ ｔｈｅｂｅｓｔ．ＩＴＳｓｈｏｗｅｄｔｈｅｌａｒｇｅｓｔｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｆｉｃｖａｒｉａｔｉｏｎ，ｆｏｌｌｏｗｅｄｂｙｐｓｂＡ－ｔｒｎＨｓｅｑｕｅｎｃｅ；ｍａｔＫｗａｓｔｈｅｗｏｒｓｔ．Ｔｈｅｔｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓｏｆＸａｎｔｈｉｕｍｗｅｅｄｓｃｏｕｌｄｂｅｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈｅｄｂｙＩＴＳ２ｒｅｇｉｏｎｕｓｉｎｇｉｎｔｅｒ－ｓｐｅｃｉｆｉｃＫ２ＰｇｅｎｅｔｉｃｄｉｓｔａｎｃｅａｎｄＮＪ ｔｒｅｅ．ＱｕａｒａｎｔｉｎｅａｎｄｃｏｍｍｏｎＸａｎｔｈｉｕｍｐｌａｎｔｓｃｏｕｌｄｂｅｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈｅｄ