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DNA与RNA复制
DNA和RNA的生物合成 一 DNA的复制 一、DNA的半保留复制 解旋解链,形成复制叉: DNA的超螺旋及双螺旋结构解开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。单链DNA结合蛋白(SSB)结合在两条单链DNA上,形成复制叉。 DNA复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称为复制叉。 引发体组装: 由蛋白因子(如dnaB等)识别复制起始点,并与其他蛋白因子以及引物酶一起组装形成引发体。 引发 在引物酶的催化下,以DNA为模板,合成一段短的RNA片段,从而获得3端自由羟基(3-OH)。 聚合子代DNA: 由DNA聚合酶催化,以3‘→5’方向的亲代DNA链为模板,从5‘→3’方向聚合子代DNA链。在原核生物中,参与DNA复制延长的是DNA聚合酶Ⅲ;而在真核生物中,是DNA聚合酶α(延长随从链)和δ(延长领头链)。 引发体移动: 引发体向前移动,解开新的局部双螺旋,形成新的复制叉,随从链重新合成RNA引物,继续进行链的延长。 去除引物,填补缺口: 在原核生物中,由DNA聚合酶Ⅰ来水解去除RNA引物,并由该酶催化延长引物缺口处的DNA。而在真核生物中,RNA引物的去除,由一种特殊的核酸酶来水解,而冈崎片段仍由DNA聚合酶来延长。 依赖Rho (ρ)因子的转录终止 非依赖Rho因子的转录终止 反转录 逆转录:以RNA为模板,合成DNA。与通常转录过程中遗传信息流从DNA到RNA的方向相反。 反转录酶 (1)RNA指导的DNA聚合酶活力(以RNA为模板,合成一条互补的DNA,形成RNA—DNA杂种分子)。 (2)RNase H酶活力,水解RNA—DNA杂种分子中的RNA,可沿3’→5’和5’→3’两个方向起外切酶作用。 (3)DNA指导的DNA聚合酶活力。 DNA的损伤及修复 损伤原因 物理(紫外、高能射线、电离辐射) 化学(烷基化试剂、亚硝酸盐、碱基类似物) 生物因素(碱基对置换、碱基的插入/ 缺失造成移码) 修复 光复活 紫外线损伤的光复活过程 A形成嘧啶二聚体 B光复合酶结合于损伤部位 C酶被可见光激活 D修复后释放酶 切除修复 细菌的限制修饰系统 限制性内切酶:有自己的识别位点,可形成平头和粘性末端 修饰甲基化酶:保护 重组基因与DNA克隆 聚合酶链反应(PCR)技术与DNA扩增 RNA的生物合成 一、DNA指导的RNA合成(转录) 转录 单顺反子:为一条多肽链编码的mRNA称为单顺反子-真核生物 多顺反子:为多条肽链编码的mRNA称为多顺反子-原核生物 负链(有意义链):模板链。 正链(反意义链):编码链 RNA合成的基本特征 ①底物:NTP(ATP、GTP、CTP、UTP) ②RNA链生长方向:5’→3’ ③不需引物 ④需DNA模板 二、原核生物的转录 起始---延长---终止 E.coli RNA聚合酶(原核) E.coli RNA聚合酶全酶|由α2ββ’ σ组成 无σ亚基的酶叫核心酶,核心酶只能使已开始合成的RNA链延长,而不具备起始合成活性,加入σ亚基后,全酶才具有起始合成RNA的能力,因此,σ亚基称为起始因子。 5’ 3’聚合活性 合成起始不需引物 三、真核生物RNA聚合酶 真核生物的转录机制要复杂得多,有三种细胞核内的RNA聚合酶: RNA聚合酶I转录rRNA, RNA聚合酶II转录mRNA, RNA聚合酶III转录tRNA和其它小分子RNA。 (一)转录起始 转录起始需解决两个问题: RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。 DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。 四、原核生物的转录过程 2. DNA双链解开 1. RNA聚合酶全酶(?2????)与模板结合 3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物 转录起始过程 (二)转录延长 1. ?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移; 2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。 (NMP) n + NTP ?? (NMP) n+1 + PPi 5? 3? DNA 原核生物转录过程中的羽毛状现象 核糖体 RNA RNA聚合酶 (三)转录终止 指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。 分类 * * 复制:以亲代DNA或RNA为模板,根据碱基配对的原则,在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或
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