基于序列疏水值震荡的折叠速率预测.pdfVIP

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第 ??卷 第 ?期? 生 物 信 息 学? ???.?????.?? ???????年 ?月? ?????????????????????????????????? ???.,????? ???:??.????/?.????.????— ????.????.??.??? 基 于序 列疏 水 值 震 荡 的 折 叠速 率预 测? 胡 睿 ,史小红?,李晋惠? ?西安工业大学理学 院,陕西 西安 ???????? 摘 要 :蛋 白质折 叠速 率的正确 预测 对理 解蛋 白质 的折叠机理非常重要。本文 从伪氨基 酸组成 的方 法 出发 ,提 出利用序 列疏? 水值震荡 的方法来提取蛋 白质 氨基 酸的序 列顺序 信息,建 立 线性 回归模 型进 行折叠速 率预测 。该 方法 不需要 蛋 白质 的任何? 二级结构 、三级结构信息或结构类信息 ,可直接从序 列对蛋 白质折叠速率进行预测。对含有 ??个蛋 白质 的数据集 ,经过 ????.? ?????交互检验验证 ,相 关系数达 到 ?.???,表 示折叠速 率预测值 与实验值 有很 好的相关性 ,说 明 了氨基 酸序 列信 息对 蛋 白质折? 叠速率影响 重要 。同其他方 法相 比,本文 的方法具有计算简单 ,输入参数少等特点。? 关键词 :蛋 白质折叠 ;折 叠速 率;疏水值震荡 ;伪氨基 酸组成;回归分析? 中图分类号 :????;? 文献标识码 :?? 文章编号 :????— ??????????一??— ???— ??? ?????????????????????????????—— ?????????????????????????????????????????????? ??????,?????????????? ,??????????? ??????????????????,??’???????????????????????????,??’?????????,??????? ????????:???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????.????? ??????????????????????????,??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????,? ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????. ?????????????????????

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