基于直接和间接PPI信息预测人类核蛋白亚核定位.pdfVIP

????年 ?月? 内 蒙 古 大学 学 报 ?自然 科 学 版 ?? ????．? ????? 第 ??卷 第 ?期? ????????????????????????????????????????????????????????????? ???．?????．?? 文 章 编 号 ：????— ?????????????????—??? 基 于 直 接 和 间 接 ???信 息 预 测? 人 类核 蛋 白亚 核 定 位? 王? 雷 ，王颜超 ，辛? 润 ，徐 嘉 良，李 前忠? ?内蒙 古 大 学 物 理 科 学 与 技 术 学 院 ，呼 和 浩 特 ???????? 摘要 ：构建了含有五个亚核区域共 ???条蛋白质的单定位人类核蛋白数据库．选取蛋白质相? 互 作 用 信 息 分 数 为 信 息 参 数 ，提 出通 过 引 入 蛋 白 质 一 级 间 接 相 互 作 用 预 测 蛋 白质 亚 核 定 位 的? 新 算 法 ，对 人 类 核 蛋 白 亚 核 定 位 进 行 了预 测 ．对 染 色 质 、核 仁 两 区 域 ???条 蛋 白质 的 ?????????? 检 验 总 预 测 成 功 率 为 ??．??? ．对 染 色 质 、核 仁 、核 基 质 、核 斑 四 区 域 ???条 蛋 白质 的 ?????????? 检 验 总 预 测 成 功 率 为 ??．??? ．? 关键 词 ：人类核蛋白；亚核定位 ；蛋白质相互作用；蛋白质一级间接相互作用? 中 图分类 号 ：???? 文献 标志 码 ：?? 细胞 核是 细胞 内最 大 的细胞 器 ，是细 胞生 命 活动 的控制 中心 ．核 蛋 白的功 能与 其在 细胞 核 中的定? 位 密切 相关 ．在 过 去 的二 十 几年 中 ，人 们对 蛋 白质 亚细 胞 定位 的预 测取 得 了很 大进 展 ，出现 了许 多 预? 测 方法 ．近 年来 ，蛋 白质定 位 的研 究逐 渐进 入 亚核领 域 ，相对 于亚 细胞 定位 的预 测来 说 ，对 亚 核定位 的? 预测是 更 深层 次 的问题 ．在 过去 亚核 定位 预测 研究 工作 中 ，本研 究组 提 出的最 小离 散增 量算 法取得 了? 较 好 的预 测成绩? ，该方 法在 蛋 白质 相关 方 面 的 预 测 中也 得 到 了成 功 的应 用????．细 胞 核结 构 复 杂 ，? 核 蛋 白质所 处 区域 也不稳 定 ，发展 亚 核定 位 的预测 方法 更具 挑战 性．? 最 近 几年 ，蛋 白质 相互 作用 ?????信息 开始 被 用来 预测 蛋 白质定 位 ，取 得 了不错 的效 果．????等? 人 利用 ???网络 预测 了 ???个 人 类体 液 蛋 白质 的定 位 ?血浆 、血 清 等 ?，?????????检 验 预测 成 功率 为? ??．????／?．????等人结 合 ???信 息预 测 ????个 酵母 菌蛋 白质 的亚 细胞 定位 ，?????????检验 预 测成 功? 率 为 ??．??? ．? 本 文构 建 了人类 核 蛋 白 ???网络 ，推 导 了经 蛋 白质一 级 间接 相 互 作 用 修 正 的预 测 算 法 公 式 ，结? 合 蛋 白质 直接相 互作 用 和蛋 白质 一级 间接 相互 作用 信息 ，预 测 了人类 核蛋 白的亚核 定位 ．