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医学图像格式转换及读取与显示
医学图像格式转换及读取与显示
医学图像格式转换
通常从机器拷贝出来的医学图像数据为DICOM格式,如果是多种模态图像混合,则需要使用Dcm2AsiszImg.exe工具把多模态图像分类出来,软件如下图所示:
Dcm2AsiszImg 是一个接收、发送 DICOM 图像、把 DICOM 图像进行分类、
把 DICOM 转化为安科 Img 图像格式的软件工具。
用法:
“输出目录”选择待转化的图像保存路径,“DICOM图像分类”选择要转化的原始图像目录,最后点击“DICOM图像分类”,输出图像分辨率为256*256。
常用的图像格式还有ANALYZE和NIFTI,ANALYZE格式的图像包括图像文件.img和头文件.hdr,应用于SPM2。NIFTI把图像文件和头文件合并为.nii文件,应用于SPM8、FSL、FreeSurfer等。可以利用MRICron软件的dcm2niigui.exe插件把DICOM格式转化为ANALYAZE 和NIFTI格式。
在Help下的preference处可设置输出参数:
读取与显示DICOM图像
Matlab提供了dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid 、dicomwrite函数,可实现DICOM格式图像的读取、显示、保存等操作,以及查看扫描信息。
读取与显示NIFTI格式图像
MRIcro软件可以显示NIFTI图像
① NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。
具体如下:
[hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr(output.hdr);
[img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine);
save_nii(nii, filename, [old_RGB]);
② SPM方法:
help spm_read_vols
V = spm_vol_nifti(output.hdr)
[Y,XYZ] = spm_read_vols(V);
Freesurfer的mgh图像读取与显示
Freesurfer安装目录下有一个matlab程序包,提供了load_mgh, save_mgh等函数实现该文件的读取与显示。
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