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简易聚类分析~能力分组
簡易聚類分析~能力分組
一、研究動機:
我們由綠豆成長的實驗中,S1,S2,S3為照光組、D1,D2,D3為暗室組)。很清楚的,如果我們要依據莖的長度將這六顆綠豆分成兩組,那顯然是S1,S2,S3一組,D1,D2,D3一組。這樣直觀的分組結果與實驗的結果不謀而合(即照光組與暗室組)。
然而,這種直觀的分組方法其實就是利用距離近的在一組的觀點來處裡的。我們就以此為出發點,
〔 圖 一 〕
二、研究目的:
比較聚類分組與傳統能力分組的差別。
若假設數學及生物為國一的理科科目,我們想利用這兩科成績來對班上的同學做一理科能力分組。
三、文獻探討:
聚類分析是屬於數學領域中的統計範疇,由於近年來電腦運算速度大為提昇,因而讓聚類分析得以實際運用於日常生活中。但由於聚類分析的方法(如階層法中的”對觀察對象的聚類(Clustering Case)”-包括有單一、平均、中線、最大、最小連結法等等(見參考資料及其他1))幾乎都是需要龐大的運算,因此,本文提出一個改進聚類分析的方法,使之可以由人力來處理運算之,並對傳統能力分組與聚類分組做一些探討。
四、研究設備器材:
免洗碗容器、綠豆、土壤、水。
五、研究方法:
首先我們先於照光及暗室環境下培養綠豆並記錄其莖長。
(一)實驗步驟:
架設培養環境(照光及暗室)。
於此兩環境中各種植3顆綠豆,並依序編號-光照組S1,S2,S3及暗室組-D1,S2,D3。
每天晚上9點記錄各株的莖長。
(二)紀錄結果如下〔表一〕:
莖長(公分) 1天 2天 3天 4天 5天 6天 7天 8天 9天 10天 11天 12天 照
光
組 S1 0 0 0 0 0.5 1 2 3.5 4 4.5 5.5 5.5 S2 0 0 0 0 0 0.8 1 2.8 4 6 7 8 S3 0 0 0 0 0 0 0.5 2.5 3 4 5 5 暗
室
組 D1 0 0 0 0.5 1 3 5 7 9 11 13 14 D2 0 0 0 0 0.5 1 2 6 7 9 11 12 D3 0 0 0 0 1 2 4 6.5 8 10 10.5 11 〔 表 一 〕
由上〔表一〕中可以看出從第8天後,這兩組的莖長便有很明顯的差距,接下來我們便要由距離近的在一組的數學方法,來將這六顆綠豆分組。
(三)聚類分組:
步驟一:求出各物種兩兩間的距離。
步驟二:找出步驟一中距離最近的兩物種,並將此兩物種視為一組(即為新的物
種)。
步驟三:重複步驟一,直到所有物種聚類到不能聚類為止。
現在我們就取第10天的六顆綠豆莖長資料來說明之。根據步驟一,我們先求出每顆綠豆莖長兩兩的差,整理如下〔表A〕:
S1 S2 S3 D1 D2 D3 S1 0 1.5 0.5 6.5 4.5 5.5 S2 - 0 2 5 3 4 S3 - - 0 7 5 6 D1 - - - 0 2 1 D2 - - - - 0 1 D3 - - - - - 0 〔 表 A 〕
由〔表A〕可以看出這些數據是對稱的,故我們只需列出上三角的數據即可,我們稱這些數據為一距離矩陣。根據步驟二所示,我們可以了解S1及S3間的距離最近,只有0.5;因此,我們便將S1及S3視為一組,並重複步驟一求出新的距離矩陣,整理如下〔表B〕:
S1
S3 S2 D1 D2 D3 S1
S3 0 1.75 6.75 4.75 5.75 S2 - 0 5 3 4 D1 - - 0 2 1 D2 - - - 0 1 D3 - - - - 0 〔 表 B 〕
於〔表B〕中的(S1,S3)與S2間的距離為使用”平均連結法(Average Linkage)”(見參考資料及其他2),即
=(+)=(1.5+2)=1.75
很明顯的,我們又可以看出D2及D3間的距離最近,只有1(當然D1及D3間的距離也是1,不過在此我們先舉D2及D3說明);因此,我們便將D2及D3視為一組,並再重複步驟一求出新的距離矩陣,整理如下〔表C〕:
S1
S3 S2 D1 D2
D3 S1
S3 0 1.75 6.75 5.25 S2 - 0 5 3.5 D1 - - 0 1.5 D2
D3 - - - 0 〔 表 C 〕
同樣的〔表C〕中的(S1,S3)與(D2,D3)間的距離求法亦是使用平均連結法,即
=(+++)
=(4.5+5.5+5+6)=5.25
同樣的,將距離最近的D1及(D2,D3)視為一組,並再重複步驟一求出新的距離矩陣,整理如下〔表D〕:
S1
S3 S2 D1
D2
D3 S1
S3 0 1.75 5.75 S2 - 0 6 D1
D2
D3 - - 0 〔 表 D 〕
由〔表D〕將距離最近的(S1,S3)及S
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