马松山无序和关联对DNA分子电子结构及输运性的影响.ppt

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* * DNA分子的电子结构及输运特性 马松山 中南大学物理学院 2007.10 汇 报 概 要 一. DNA分子电学性质研究现状 二. DNA分子链模型 三. DNA分子链电子结构 四. DNA分子链电子输运特性 一、DNA分子链电学性质研究现状 一方面,DNA分子链电学性质的研究已成为物理学 与生物学研究的热点。 (1). 生物领域的应用(放射损伤修复、生物合成等) Arkin M R, 1996,Science,372,475; Murphy C J 1993,Science,262,1015. (2). 制备生物纳米材料和分子器件(分子传感器、分子导线等) Lewis F D, 1997,Science,277,673; Dondliker P H, 1997,Science, 257,1465. 一、DNA分子链电学性质研究现状 2. 另一方面,对DNA分子链电学特性的研究颇有争议。 (1). DNA是否导电? 导体(Fink H W,1999,nature,398,407) 半导体(Porath D,2000,nature,403,635) 绝缘体(Zhang Y,2002,PRL,89,198102;Storm A J,2001,APL,79,3881) 超导体(Kasumov A Y,2001,Science,291,280) (2). DNA怎样导电? 短程隧穿(Harriman A,1999,Angew Chem,Int Ed,38,945) 长程传输(Murphy C J,1993,Science,265,1025;Arkin M,1996, 273, 475). 跳跃输运(Pedro C,2002,Nature,418,955;Yu Z G, 2001, PRL,2001, 86, 6018) 二、DNA分子链模型 DNA分子链结构 DNA分子双螺旋链状结构的4种核苷酸中,胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)、腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)相互成对构成碱基对C-G和A-T。 2. DNA分子链模型 (1). 绝对零度DNA分子链的一维二元无序模型 其中N 为系统的长度,即DNA分子链的碱基对的总数, 为近邻格点间的交叠积分, 为格点位能,以p和1-p的几率取两种碱基对的位势 、 ,故 代表体系的格点能量无序度, 为Wannier表象中的基本函数。 References: 1.Pedro C,2002,Nature,418,955. 2.W.Zhang and S.E.Ulloa,2004,Phy.Rev.B,69,153203. (2). 有限温度DNA分子链的模型 有限温度时,相邻碱基之间因热运动而发生相对扭转,产生一个与温度有关的相对扭转角度,导致格点间的跳跃积分对温度的依赖关系。(研究中我们取4种可能的格点势 ) 为遵循高斯分布的独立随机变量,    其取值遵守能量均分定律 对系统所有碱基的平均为零 (3). 非对角关联DNA分子链的模型 碱基对A-T之间的跳跃积分表示为 碱基对C-G之间的跳跃积分表示为 碱基对A-T和C-G之间的跳跃积分表示为 (b)典型局域关联 (c)黄金关联 (a)Anderson无序 三、DNA分子链的电子结构 1. 计算方法 根据DNA分子链模型,体系的薛定谔方程可表示为 在负本征值理论及无限阶微扰理论的基础上,通过发展多对角全随机厄米矩阵本征问题求解方法,从而可以求解DNA分子链的本征值、本征矢及其分布,从而研究其电子态密度、局域态分布等电子结构特征。 当碱基对数为N时,可令边界条件为 , 对应方程可记为: 故DNA分子的本征值、本征矢可通过如下方程求得: 在求解本征值和本征矢过程中,不可避免会有误差,我们取: 作为误差标准,当本征值和本征矢有误差时, ,故 的大小反映了误差的大小,且由上式定义的误差与本征值误差 有如下关系: 由于无序的存在,一维DNA分子链的电子态呈现出局域化特性,对于每一电子波函数局域态,其局域化程度可以用波函数的局域长度来描述,对应于能量本征值 电子波函数局域长度 可表为: 可见,当本征值误差 一定时,如误差 越小,则本征矢分量 最大,而本征值矢分量最大即对应态的中心位置。 References: 1.S.Y.Wu and Z.B.Zhang,1981, Phy.Rev.B,24,4787. 2.吴式玉,郑兆勃,1981,物理学进展,1(1),125. 2. 电子结构特征 (1). 绝对零度DNA分子链的电子结构

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