分子遗传学解读.doc

第一章 1.基因组（Genome）：由德国汉堡大学威克勒教授于1920年首创，指生物的整套染色体所含有的全部DNA或RNA序列。基因组是地球上每一物种具有的生物学信息的存储库。 2.基因组学（Genomics）：由罗德里克于1986年首创，指研究生物的整个基因组，涉及基因组作图、测序和功能分析的一门学科。 3.ranscriptomes:基因组表达的最初产物是转录组，即那些含有细胞在特定时间所需生物信息、编码蛋白质的基因衍生而来的RNA分子的集合。转录组由转录过程来维持。 4.proteomes:基因组表达的第二个产物是蛋白质组，即细胞中那些决定细胞能够进行生化反应的所有蛋白质组分。这是通过翻译过程来完成的。 5. 证明基因由核酸 (DNA或RNA) 组成的3个著名实验： ①肺炎双球菌的转化试验；②噬菌体感染实验；③烟草花叶病毒的感染实验。 6. DNA双螺旋结构模型： 由Watson and Crick (1953) 提出的 DNA分子通常以右手双螺旋形式存在，两条核苷酸链反向平行，且互为互补链。戊糖－磷酸骨架在分子的外铡，在分子表面形成大沟和小沟，碱基堆积于螺旋内部.碱基间通过氢键相互连接，A和T以2个氢键配对，G和C以3个氢键配对.螺旋中相邻碱基间相隔0.34nm，每10个碱基对螺旋上升一圈，螺距为3.4nm，直径为2.37 nm。 7. DNA双螺旋结构的稳定力： ①碱基间形成的氢键，②相邻碱基间的疏水堆积力，③碱基相互作用的范德华力。 8. 基因表达系列分析（Serial analysis of gene expresion, SAGE）：SAGE技术不是研究完整的cDNA，它产生长度12bp的短序列，每一条都代表了转录组中存在的一种mRNA。 技术基础：412=16,777,216 bp，真核mRNA平均1500 bp，412相当于11,000个转录物，这比最复杂的转录组中存在转录物数目还多，因此12bp序列能够代表某一种 mRNA。 9. 通过微阵列或芯片分析来研究转录组 109拷贝，过量优点：可用于快速评估两个或多个转录组间的差异。 10. The four levels of protein structure ⑴ primary structure：氨基酸通过肽键连接成一条多肽链。 ⑵ secondary structure：指多肽采取的不同构象，由不同氨基酸之间形成的氢键所稳定。 例如：?螺旋；?片层 ⑶ tertiary structure：是将多肽链的二级结构组分折叠成为三维构型而形成的。 它被各种化学力所稳定： ①氨基酸残基间的氢键；② 带电荷的氨基酸R基团间的静电相互作用；③ 疏水相互作用； ④半胱氨酸残基间的二硫键 ⑷ quaternary structure：两条或更多已形成三级结构的多肽链组合在一起形成一个多亚基蛋白质。 11. 鉴定与某一蛋白质相互作用的蛋白质： a. 噬菌体展示 ：该技术采用了一种基于?噬菌体或某种丝状噬菌体的独特的克隆载体。 b. 酵母双杂交： 激活因子（转录因子）：一类控制基因表达的蛋白质，包含DNA结合结构域和转录激活结构域。双杂交系统使用缺乏某一报告基因相应激活因子的酿酒酵母菌株，此时报告基因是不表达的。 12.编码RNA和功能RNA 的区别： 编码RNA占总RNA的4%,coding RNAhnRNA合mRNA 功能RNA: 占总RNA的96%,合成pre-rRNA,pre—tRNA,sn-RNA(核小RNA),sno-RNA(核仁小RNA),mi-RNA(微小RNA),si-RNA(短干扰RNA). 第二章 1.DNA重组技术：借助工具酶按预定的方式操作DNA分子，将DNA分子切成小片段，并重新将它们连接在一起，形成自然界不存在的组合体。 2. 不同类型的酶： ①末端修饰酶：改变DNA分子末端，为连接实验的设计增加可操作空间。 A. 末端脱氧核糖核苷酸转移酶：属于模板非依赖的DNA聚合酶。 B. 碱性磷酸酶：去掉DNA分子5’端磷酸基团，从而阻止这些分子连接到其他分子上。 C. T4多聚核苷酸激酶：向DNA分子 5’端添加磷酸基团，主要用于DNA分子的末端标记。 ②DNA聚合酶：以现有DNA或RNA分子为模板合成DNA的酶，称为（依赖模板的）DNA聚合酶。 ③核酸酶 ④DNA连接酶：通过DNA连接酶可以将限制性内切核酸酶消化产生的DNA片段重新连接起来，或者连接到一个新的分子上。 T4 DNA连接酶：从T4噬菌体感染后的大肠杆菌细胞中提取。 3. 研究中使用的DNA聚合酶类型 ①DNA聚合酶I (Kornberg聚合酶) 的不同版本，② Klenow聚合酶：用枯草杆菌蛋白酶处理DNA聚合酶I，可获得两个片段，大片段的分子质量约76 kDa，保留聚