化学信息学课件.docVIP

第一章化学信息概论 一、化学信息学的产生和发展 信息：实物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。 化学学科的重要性 化学信息量的快速增长 化学信息学：是应用信息学方法解决化学问题的学科。（化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。） （利用数学、统计学与计算机科学的理论、方法和网络技术作为手段，研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用，在此基础上进行知识创新，促进化学学科的发展。） 二、化学信息学的研究领域 应用现代信息技术构建信息处理系统，处理长期积累的大量化学信息资源，帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据，正确地预测化学物质的性质，开发新化合物、材料和方法。 应用计算机科学方法或信息学解决化学问题，对化学信息进行有效的存储、操作和处理，使化学信息合理地提升为化学知识。 研究内容：化学、化工文献学；化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输；化学图形学；化学信息的解析与处理；化学知识的计算机推演；化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。 三、信息资源检索的意义与作用 ? 启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。 ? 拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界，需要接受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。 ? 培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。 ? 提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。 四、化学信息学的课程内容 化学信息的产生和获取（重点） 利用检索工具 通过实验方法 ... … 化学信息的表达、存储和管理 化学运筹学 数据整理可视化 数据库管理技术 ... ... 化学信息的加工和处理 化学计量学 化学软件 目的是获取更多的信息 化学信息的深化 计算机模拟设计 化学结构的可视化以图形的方式对化学信息进行描述 1.2 电子信息和数据库 一、电子信息 指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。 1、联机信息资源，如：Dialog, STN, OCLC数据库 2、光盘信息资源，包括单机版、网络版、联机版 3、Internet网络信息资源 二、数据库 数据库是以特定方式合理地组织相互关联的数据集合。 （一）数据库的结构 1、记录型文献数据结构 常用的字段：标题、作者、地址、期刊名、学科、文件类型、语种和摘要。如表1-1（p7） 2、记录的排序和索引 （1）顺排文档：按记录号顺序排列； （2）倒排文档：各个记录按照某一字段的值进行排列。 1.3 信息检索的方法和步骤 二、信息检索的评价 1、评价指标：查全率、查准率、漏检率、误检率、响应时间、用户负担、输出形式等。 2、查全率和查准率 （1） 查全率（R）：检索出的相关信息量（w）与该系统信 息库中存储的相关信息量（x）的比率称为查全率， R=w/x × 100 % 。 （2）查准率（P）：检出的相关信息量（w）与检出信息总量（m）的比率称为查准率， P= w/m× 100% 。两者之间存在互逆关系，即查全率高时，查准率较低，反之亦然。 （3）漏检率（O） ：O = 1 – R = 1- w/x × 100 % 。 （4）误检率（N）： N = 1 - P = 1-w/m × 100 % 。 如果一个检索系统中与某一课题相关的信息共250 条。检索操作后，实际检出了400条信息，其中相关信息为200条，此次检索效率可计算为： R = [200 /250] × 100 %=80% O = 1-80% = 20% P = [200/400] × 100%=50% N = 1-50%= 50% 2、位置检索： With （W、nW），表示算符两侧的检索词按此前后衔接的顺序排列，词序不可颠倒。 Near （N、nN）表示算符两侧的检索词必须紧密相连，两词词序可变。 Subfield （ S ）表示算符两侧的检索词必须同时出现在文献记录的同一子字段（句子、短语）。 Field（F）表示算符两侧的检索词必须同时出现在同一个字段中。 Citation（ C）表示算符两侧的检索词必须同时出现在一条文献的记录中。 Link（ L）表示算符两侧的检索词之间有一定的从属关系。 4、限词检索 基本检索字段：题名、文摘、主题词、标识词 辅助检索字段：作