柞蚕功能基因研究进展--沈阳农业大学柞蚕研究所刘彦群研.pptVIP

汇报内容 一、研究组简介 一、研究组简介 一、研究组简介 一、研究组简介 一、研究组简介 二、研究进展 1、柞蚕EST测定与转录组测序 1、柞蚕EST测定与转录组测序 2、柞蚕功能基因克隆 2、柞蚕功能基因克隆 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 三、当前重点研究工作 致谢 * 柞蚕功能基因研究进展——沈阳农业大学柞蚕研究所刘彦群研究组 汇报人： 刘彦群、李玉萍 2011.03 一、研究组简介 二、研究进展 三、当前重点研究工作 背景： 在家蚕基因组与功能基因组研究取得巨大进展和成功的背景下，我们于2008年组建了柞蚕基因组与功能基因组研究组。 人员： 固定成员已由最初的2人增长为6人（刘彦群、李玉萍、夏润玺、王欢、李群、秦利）。 现有研究生6人，今年准备招生4人。包括特种经济动物饲养、动物学两个专业。 研究领域： （1）以构建的柞蚕全长cDNA文库和完成的柞蚕转录组信息资源为平台，克隆和鉴定柞蚕特异基因和重要功能基因； （2）利用基因组学技术和分子系统学方法，开展柞蚕遗传与进化研究。 目前承担的国家自然科学基金课题： （1）面上项目（柞蚕蛹滞育解除期高丰度表达的KK-42结合蛋白基因的功能分析； 2011.01 ~ 2011.12；刘彦群）。 （2）青年科学基金（柞蚕mtDNA控制区遗传多样性与系统进化；2009.01 ~ 2011.12；刘彦群）。 （3）面上项目（柞蚕神经肽PBAN的受体鉴定及其作用的信号转导分析；2011.01 ~ 2013.12 ；魏兆军、李玉萍）。 发表论文： 2008年至今， 在《International Journal of Biological Sciences》、《Annals of the Entomological Society of America》、《Journal of Insect Science》、《Molecular Biology Reports》、《Acta Biochimica et Biophysica Sinica》、《蚕业科学》等发表24篇相关论文，包括13篇SCI论文（2008年1篇；2009年2篇；2010年9篇；2011年已发1篇，已投稿2篇）。 1、柞蚕EST测定与转录组测序 2、柞蚕功能基因克隆 EST测定： （1）构建了一个柞蚕全长cDNA文库，为基因的克隆奠定了基础； （2）获得了1500条柞蚕EST，拼接后得到779个一致性序列，被注释的一致性序列达533个，未被注释的一致性序列达246个； （3）识别了200个新的EST； （4）获得了313条柞蚕基因全长cDNA序列。 转录组测序： （1）合作者合肥工业大学魏兆军博士研究组已经利用Solexa技术完成了滞育解除期柞蚕蛹的转录组分析。总共获得84322 个contig，注释为38438 个unigene。 （2）我们正在利用同样的技术进行滞育中期蛹的转录组分析。仍将进行注定滞育蛹和注定不滞育蛹的转录组分析。 （3）旨在分离与柞蚕滞育相关的基因。 （1）鉴定了柞蚕KK-42结合蛋白基因，查明其与蛹滞育密切相关。 （2）鉴定了烯醇化酶I、II基因。烯醇化酶I基因在温度刺激时是可调的。烯醇化酶II基因与生殖有关。 （3）鉴定了柞蚕溶血磷酯酶基因、长寿基因、肌球蛋白轻链2基因、异常翅节蛋白基因、腺苷酸转移酶基因、延伸引子-1α基因、肌动蛋白基因。 最近，又鉴定了柞蚕血小板活化因子乙酰水解酶基因、亚精胺合成酶基因、磷酸丝氨酸转氨酶基因、硒磷酸化物合成酶基因、赖氨酰-tRNA合成酶基因、牻牛儿基牻牛儿醇转移酶、NIMA相关激酶基因等，完成了表达模式分析。还分离了4个小分子量热激蛋白基因、1个微卵黄原蛋白基因。相关论文正在整理中。 1、柞蚕蛹滞育相关的KK-42结合蛋白基因的功能分析 2、利用转录组技术分离柞蚕蛹滞育相关基因 1、KK-42结合蛋白基因的功能分析： （1）咪唑类化合物（KK-42）是一种昆虫生长调节因子，能加快昆虫（如柞蚕、天蚕、家蚕等）甚至节肢动物（如对虾）幼虫的早熟变态； （2）并且能解除天蚕的卵滞育和棉铃虫的蛹滞育。我们的试验表明，也能解除柞蚕的蛹滞育（需要进一步重复验证） 1、KK-42结合蛋白基因的功能分析： （3）KK-42结合蛋白与天蚕的卵滞育解除有直接关系(Shimizu et al., 2002; Ya