生物化学第3章氨基酸课件.pptVIP

第3章 氨基酸(Amino acids) 一、氨基酸——蛋白质的构件分子 氨基酸的结构通式 氨基酸通过肽键（酰胺键）连接成肽 二、氨基酸的分类 常见的蛋白质氨基酸Ⅰ 常见的蛋白质氨基酸氨基酸Ⅱ 常见的蛋白质Ⅲ 常见的蛋白质氨基酸Ⅳ 常见的蛋白质氨基酸Ⅴ 氨基酸按其R基的极性分类（pH7时） 不常见蛋白质氨基酸Ⅰ 不常见蛋白质氨基酸Ⅱ 不常见蛋白质氨基酸Ⅲ 不常见蛋白质氨基酸Ⅳ 不常见蛋白质氨基酸Ⅴ 非蛋白质氨基酸Ⅰ 非蛋白质氨基酸Ⅱ 非蛋白质氨基酸Ⅲ 非蛋白质氨基酸甲状腺素 三、氨基酸的酸碱化学 甘氨酸兼性离子的解离 甘氨酸的滴定曲线 Handerson-Hasselbalch公式 谷氨酸和赖氨酸的滴定曲线 谷氨酸的解离反应式和pI计算 赖氨酸的解离反应式和pI计算 部分氨基酸的解离常数和等电点 甘氨酸的氨基与甲醛的反应 氨基酸的甲醛滴定曲线 四、氨基酸的化学反应（一）α－氨基参加的反应1.与亚硝酸反应 2.与酰化试剂反应 其它酰基化试剂 3.烃基化反应与 DNFB 反应 3.烃基化反应与 PITC 反应 4.形成西佛碱反应 （二）α－羧基参加的反应1.成盐和成酯反应 2.成酰氯反应 3.叠氮反应 （三）α－氨基和α－羧基共同参加的反应1.与茚三酮反应 亚氨基酸与茚三酮反应的产物 2.成肽反应 （四）半胱氨酸巯基参加的反应1.与碘乙酸反应 2.与氮丙啶反应 3.与含汞化合物反应 4.与二硫硝基苯甲酸反应 5.两个巯基氧化成二硫键 6.蛋白质中二硫键的氧化和还原 7.蛋白质中二硫键的被DTT还原 五、氨基酸的光学活性和光谱性质 苏氨酸的4种光学异构体 部分氨基酸的比旋光度 Murchison陨星 ——地球外偏手性的发现 四种特殊氨基酸的结构式 芳香族氨基酸在pH6时的紫外吸收光谱 Lambert-Beer 定律 六、氨基酸混合物的分析分离 逆流分溶原理 分溶曲线 分溶曲线与转移次数n的依数关系 柱层析装置 氨基酸的纸层析图谱和 Rf 值 苄氧甲酰氯 苄氧甲酰氨基酸 （保护氨基） （氨基酸鉴定） return （氨基酸鉴定） return （酶与底物过渡态中间物的结合方式之一） （用于甲醛滴定） （保护羧基） （活化羧基） （活化羧基） （氨基酸定量测定） 紫色 亮黄色 （环状二肽） 甘氨酸 甘氨酸 二酮哌嗪 （标记巯基） return （为胰蛋白酶水解肽链提供一个新位点） return （蛋白质结晶时制备重原子衍生物） 对氯汞苯甲酸 （巯基定量测定） pH8.0, 412nm检测 （蛋白质形成二、三级结构时） （蛋白质结构研究） 胱氨酸 Cystine 反应一 反应二 （蛋白质结构研究） 二硫苏糖醇 DTT 氨基酸的相对构型 +5.6 L-Valine －11.0 L-Leucine +13.5 L-Lysine －33.7 L-Tryptophan +12.4 L-Isoleucine －28.5 L-Threonine －38.5 L-Histidine －7.5 L-Serine +12.0 L-Glutamic Acid －86.2 L-Proline +5.0 L-Aspartic Acid －34.5 L-Phenylalanine +12.5 L-Arginine －10.0 L-Methionine +1.8 L-Alanine Specific Rotation [α]D25 Degree Amino Acid Specific Rotation [α]D25 Degree Amino Acid 组成蛋白质的氨基酸都是L-氨基酸，在产生生命之前天然合成的氨基酸应该是D-和L-型的氨基酸各占一半，那么生命体中的氨基酸的构型是随机选择的吗？John Cronin和Sandra Pizzarello检测了1969年9月28号落在澳大利亚Murchison附近的陨星中的特殊氨基酸的构型，检测的4种特殊氨基酸是2-氨基-2,3-二甲基戊酸（α-methylisoleucine和α-methylalloisoleucine）、2-氨基-2-甲基丁酸（Isovaline）及2-氨基-2甲基-戊酸（α-Methylnorvaline），以避免地球上氨基酸的污染。结果发现它们中L型的比D型的分别多2~9%。 α—甲基异亮氨酸 α—甲基别异亮氨酸 异缬氨酸 α—甲基正缬氨酸 式中：I 0为入射光强，I为透过光强，T为透光率，ε为摩尔吸收系数，c为溶质浓度，l为光径。其中ε定义为：光通过1cm光径时1Mol / L溶质对该波长光的吸收值。 （1）酸水解：用6 mol/L HCl或4 mol/L H2SO4回流20h左右可使蛋白质完全水