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HIV基因组结构
HIV基因组大小约10 kb,带有编码几种病毒蛋白的开放阅读框架。HIV的最初转录本是一条全长的病毒 mRNA,被翻译为Pol和Gag蛋白。Pol前体蛋白被自身的蛋白酶裂解为逆转录酶 RT 、蛋白酶 PR 及整合酶 IN 。通过蛋白水解酶的作用,Gag前体蛋白p55产生更小的蛋白,包括p24、p17、p9、p6,以及p2和p1,Gag和Gag-Pol产物的合成比例约为2O:1 3347 。产生许多亚基因组信使RNAs mRNAs 的剪接作用对于其他病毒蛋白的合成很重要。未剪接mRNA与单剪接及多剪接mRNA的相对数目似乎是由rev基因决定的,而rev本身就是一个多剪接mRNA的产物 1266,4197 。
如上所述,gpl20、gp41膜蛋白由gpl60前体而来,而后者是全长病毒mRNA单剪接的产物。gpl60的裂解由一种叫furin的蛋白内切酶来完成 1701 ,其他剪接mRNA的基因产物组成了病毒的多种调节及辅助蛋白,这些蛋白能影响不同类型细胞内病毒的复制 见第7章 。
一种调节蛋白是Tat,它具有反式激活作用,与一些细胞蛋白一起,Tat蛋白与病毒LTR3上称为Tat应答元件的RNA环状结构 称为Tat应答元件 相互作用。Tat是上调HIV复制的一种主要蛋白 综述,见参考文献:1620,3483 。另一种病毒调节蛋白为Rev 病毒蛋白表达调节因子 ,如上所述,Rev与位于膜蛋白mRNA.内叫做Rev应答元件的顺式激活.RNA环状结构作用 1266,4197 。这种作用涉及细胞蛋白和Rev蛋白多聚体,允许未剪接的mRNA从细胞核进入细胞浆,产生子代病毒所需的全长病毒蛋白。Tat和Rev是RNA结合蛋白,与细胞因子相互作用时发挥最佳活性。
病毒蛋白的加工。某些由1 0种不I司病毒转录产物翻详而成的Hl V—l蛋白,可由病毒和细胞的蛋白酶进一步加工。由包括Tev 未在图中标出 在内的46个开放阅读框架编码16种病毒蛋白,它们构成了病毒颗粒的结构,决定病毒的酶活性,并有调节和辅助病毒复制功能。160kDa的Gag—Pol前体由毒天门冬酰蛋白酶加工成7种蛋白,包括4种Gag蛋白 MA,p17;CA,p24;晚期蛋白,p7;NC,p9 、蛋白酶 P,pl0 、逆转录酶/RNase RT,p66,p51 ,以及整合酶 IN,p32 。Env前体 gpl60 由细胞蛋白酶加工生成表面糖蛋白 SU,gpl20 和跨膜蛋白 TM,gp41 。病毒的调节和辅助蛋白——包括Tat p14 、Tev p26 、Rev p19 、Nef p27 、Vif p23 、Vpr p15 以及Vpu p16 不需要加工处理。M,豆蔻酰化。图由M.Peterlin惠赠病毒Nef蛋白 负调节因子 似乎具有包括细胞激活作用和增强病毒感染性在内的多种潜在功能,它通过与细胞蛋白相互作用来激发信号转导和细胞活化 3937 。缺乏Nef蛋白的病毒通常不能在PBMC和体内有效复制 614 见第7章 。
其他的HIV病毒基因附属产物Vif 4632 、Vpr、Vpu/Vpx影响病毒的装配、细胞周期、出芽及病毒的感染性 表1.6 1620,3362,3483 。Vif与细胞内抗性因子APOBEC3G的作用将在第5章讨论。一些研究提示,nef、vpr和vpu/vpx等辅助基因在HIV一1复制中发挥作用,这种作用可能在巨噬细胞中比CD4+淋巴细胞中更重要 231 。
正如关于这些病毒基因产物分子结构的综述中指出的那样 1620,3362,3483 ,病毒表达的调节涉及许多病毒蛋白和细胞因子间的相互作用,它们引起HIV复制的增加或降低,甚至影响到病毒潜伏感染的建立。例如,在病毒复制后期,Rev的产生能下调其自身及Tat、Nef的表达,从而使病毒的复制受限。值得注意的是,HIV编码的三种主要酶在复制周期的不同时期起作用。不难想像,它们是抗病毒治疗的首选目标 见第14章 。带有RNA酶H功能的RNA依赖的DNA聚合酶,即RT·作用于病毒复制的早期步骤,形成病毒双链DNA cDNA HIV复制的详细信息见第2章 。整合酶则在细胞核中将病毒cDNA整合到宿主染色体DNA中。在病毒颗粒的出芽过程中,蛋白酶可对Gag和Gag—Pol多聚蛋白进行加工,促成病毒颗粒成熟为感染性病毒颗粒。
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