微生物中的转座因子剖析.pptVIP

二、丝状真菌中转座因子类型 根据转座机理，可将丝状真菌的转座因子分为两大类： 1. 类似反转录病毒的反转座子 2. 类似于细菌转座因子的DNA转座子 1. 类似反转录病毒的反转座子 根据反转座子的两端是否具有类似反转录病毒的长末端重复序列LTR而分为两种类型： a. LTR-反转座子 b. 非LTR-反转座子 2. DNA转座子 结构特征与细菌转座子类似，两端具有反向重复序列，中间有编码转座酶的ORF，在靶位点两端形成正向重复序列。 第四节 酵母中的转座因子 1、转座因子分哪几类？它们之间有何异同？ 2、何谓复合转座子、复杂转座子？各有何特点？ 3、根据复制机制，将转座子分为哪几类？各有何特点？ 4、为什么说Mu噬菌体不同于一般的温和噬菌体？在应用中它与IS、Tn比较有何优点？ 5、何谓极性效应？引起极性效应的可能原因是什么？ 6、如何利用转座子进行随机诱变和定位诱变？ 7、简述三亲本杂交的原理和基本步骤？ 8、举例说明丝状真菌中转座因子的不同类型。 本章思考题 第七章 微生物中的转座因子 转座因子（transposable element）是一类广泛存在于细菌、病毒和真核生物DNA分子中一段可自主改变自身座位的DNA片段，它可以在同一细胞内DNA复制子间转移，也可以在一个复制子内部转移。 转座因子的共同特征是：插入寄主DNA后，导致基因失活；插入时在靶DNA位点产生一个短的正向重复顺序。 第一节 细菌转座因子的类型和结构 细菌转座因子分为四个类型： 插入序列（insertion sequence IS） 转座子（transposon Tn） 接合型转座子 转座噬菌体（Mu） 一、插入序列 插入序列也称IS因子，它是最简单的转座因子。 插入序列 长度/bp 反向重复序列长度/bp 靶位点长度/bp 在染色体中的拷贝数 IS1 768 23 9或8 6-10 IS2 1327 41 5 4-13 IS3 1400 38 3-4 5-6 IS4 1428 18 11或12 1-2 IS5 1195 16 4 11-12 插入序列的结构有以下3个特点： 两端含有长度为10～40bp反向重复序列 含有一个编码转座酶的长编码区 两侧有一对正向重复序列(direct repeat sequence，DR) ，长度一般为3-9bp 。 二、细菌转座子 带有抗性基因并能在不同的DNA分子之间移动的遗传单位叫做细菌转座子(bacterial transposon，Tn)。 细菌抗药性转座子一般可分为两类： 复合转座子 (composite transposon) 复杂转座子 (complex transposon) 1. 复合转座子 转座子 长度kb 遗传标记 末端特征 末端两IS排向 IS关系 IS功能 来源 Tn10 9.3 TetR IS10R IS10L 反向 2.5%差异 完整功能 功能减弱 G-细菌 Tn5 5.7 KanR IS50R IS50L 反向 1bp差异 完整功能 无功能 G-细菌 Tn903 3.1 KanR IS903 反向 相同 都有功能 G-细菌 Tn9 2.5 CamR IS1 同向 相同 都有功能 G-细菌 Tn1681 2.08 胞外肠毒素 IS1 反向 相同 都有功能 G-细菌 复杂转座子的长度约5000bp，它的两端是长度为30-40bp的末端反向重复序列(IR)或正向重复序列(DR)，中央是转座酶基因和抗药性基因。 2. 复杂转座子(TnA转座子) Tn3 res 转座酶 IR IR 解离酶 Amp IR IR 转座酶 解离酶 res Mer Tn501 IR IR 转座酶 解离酶 res Sul Str Tn21 转座子 长度/bp 遗传标记 末端反向重复/bp 两侧靶点正向重复/bp 来源 Tn1 5000 Amp 38 5 假单胞菌 Tn3 4957 Amp 38 5 沙门氏菌 Tn21 19600 Mer Str Sul 38 5 志贺菌 Tn501 8200 Hg 38 5 假单胞菌 Tn1000 5800 无 37 5 大肠杆菌 Tn551 5300 Em 35 5 金萄球菌 Tn4430 4200 无 38 5 苏云金菌 Tn4451 6200 Cam 12 不详 荚膜梭菌 Tn4456 6800 无 38 5 弗氏链霉菌 三、细菌转座子的插入机制、转座模型 转座子不同于噬菌体和质粒，它们不是独立的复制子，不能独立存在。 根据转座子在转座过程中是否复制而分为两种类型： 复制型转座和非复制型转座 据转座过程中是否有共整合体，可分为： 剪-贴型转座、保守型转座和复制型转座 1．剪-贴型转座（cut and paste t